289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4301 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4301  heat shock protein 90  100 
 
 
627 aa  1274    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2489  heat shock protein 90  60.29 
 
 
628 aa  736    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.356578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4168  heat shock protein 90  91.87 
 
 
629 aa  1181    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.160009  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0322  heat shock protein 90  53.56 
 
 
624 aa  673    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1472  heat shock protein 90  43.49 
 
 
615 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3230  heat shock protein 90  41.65 
 
 
614 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2376  heat shock protein 90  41.05 
 
 
627 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175392  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1549  heat shock protein 90  40.45 
 
 
630 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678256  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  40.58 
 
 
633 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1573  heat shock protein 90  39.53 
 
 
628 aa  463  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534584  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  40.19 
 
 
627 aa  464  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2009  heat shock protein 90  40.1 
 
 
613 aa  461  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1273  heat shock protein 90  39.45 
 
 
625 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1071  heat shock protein 90  38.67 
 
 
629 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1195  heat shock protein 90  39.42 
 
 
628 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2197  heat shock protein 90  40.06 
 
 
660 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1147  heat shock protein 90  40.42 
 
 
636 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30595  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0607  heat shock protein 90  39.49 
 
 
637 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1117  heat shock protein 90  40.03 
 
 
668 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.775392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1188  heat shock protein 90  39.55 
 
 
626 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0752  heat shock protein 90  38.81 
 
 
633 aa  433  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18793  predicted protein  39.04 
 
 
750 aa  434  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  36.49 
 
 
644 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  38.05 
 
 
636 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  38.03 
 
 
635 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  38.91 
 
 
634 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  37.8 
 
 
628 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  37.8 
 
 
628 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1800  heat shock protein Hsp90  38.86 
 
 
646 aa  425  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  38.28 
 
 
626 aa  425  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  38.02 
 
 
623 aa  422  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  37.7 
 
 
623 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  38.97 
 
 
626 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  38.06 
 
 
635 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  38.45 
 
 
630 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  38.83 
 
 
650 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  38.6 
 
 
634 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  38.45 
 
 
634 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  38.45 
 
 
634 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2002  heat shock protein 90  38.91 
 
 
613 aa  416  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.240397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  38.45 
 
 
634 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  37.48 
 
 
624 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  37.7 
 
 
629 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01327  heat shock protein 90  35.88 
 
 
634 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  37.7 
 
 
626 aa  415  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  41.54 
 
 
610 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2214  heat shock protein 90  36.7 
 
 
642 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000258546  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  36.92 
 
 
638 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  37.67 
 
 
652 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004137  chaperone protein HtpG  36.66 
 
 
634 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0814  heat shock protein 90  36.39 
 
 
632 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  37.46 
 
 
629 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  40.56 
 
 
632 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  38.4 
 
 
633 aa  415  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  40.41 
 
 
632 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  38.16 
 
 
624 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  38.16 
 
 
624 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  40.25 
 
 
632 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  38.16 
 
 
624 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  40.41 
 
 
632 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01104  heat shock protein 90  37.13 
 
 
640 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  40.41 
 
 
632 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  37.13 
 
 
633 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  40.41 
 
 
632 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  38.16 
 
 
624 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  37.05 
 
 
630 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  37.16 
 
 
624 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  40.58 
 
 
629 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  37.78 
 
 
629 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  40.41 
 
 
632 aa  412  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  38.16 
 
 
624 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  37.12 
 
 
622 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  39.26 
 
 
634 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  37.12 
 
 
624 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  39.72 
 
 
632 aa  412  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  38.16 
 
 
624 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  38.16 
 
 
624 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  40.09 
 
 
632 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  37.16 
 
 
624 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  37.16 
 
 
624 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  39.84 
 
 
632 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  37.16 
 
 
624 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  40.09 
 
 
632 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  37.12 
 
 
624 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  37.16 
 
 
624 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  38.16 
 
 
624 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  38.16 
 
 
624 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3036  heat shock protein 90  37.18 
 
 
629 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  40.41 
 
 
632 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  40.56 
 
 
632 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  34.35 
 
 
644 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  38.95 
 
 
643 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  37.62 
 
 
629 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  37.75 
 
 
635 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  38.18 
 
 
637 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  39.94 
 
 
632 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  39.78 
 
 
632 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19170  heat shock protein 90  38.83 
 
 
635 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000174366  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  40.06 
 
 
632 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  39.1 
 
 
643 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>