290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2390 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1728  heat shock protein 90  77.69 
 
 		 645 aa  1011    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000167687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  100 
 
 		 650 aa  1335    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1803  heat shock protein 90  75.5 
 
 		 644 aa  981    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  74.1 
 
 		 644 aa  984    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  93.08 
 
 		 650 aa  1203    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  51.47 
 
 		 628 aa  641    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  51.47 
 
 		 628 aa  641    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  74.73 
 
 		 644 aa  993    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  77.07 
 
 		 645 aa  1019    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2214  heat shock protein 90  51.98 
 
 		 642 aa  647    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000258546  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  51.01 
 
 		 633 aa  631  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2657  heat shock protein 90  50 
 
 		 636 aa  627  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0502417  hitchhiker  0.00031577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5377  Heat shock protein Hsp90-like protein  51.63 
 
 		 657 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  50.39 
 
 		 636 aa  621  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  49.61 
 
 		 651 aa  620  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12322  heat shock protein 90  51.09 
 
 		 647 aa  615  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2474  heat shock protein 90  50.31 
 
 		 636 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0369006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3387  heat shock protein 90  48.59 
 
 		 643 aa  609  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1817  heat shock protein 90  49.07 
 
 		 651 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290243  normal  0.0459301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  47.63 
 
 		 634 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2392  heat shock protein 90  49.92 
 
 		 646 aa  607  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  50.62 
 
 		 642 aa  607  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  50.47 
 
 		 630 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  49.38 
 
 		 630 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0243  heat shock protein 90  48.75 
 
 		 650 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  48.3 
 
 		 632 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  48.3 
 
 		 632 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  48.3 
 
 		 632 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  49.92 
 
 		 647 aa  600  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  48.3 
 
 		 632 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  48.15 
 
 		 632 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  48.75 
 
 		 639 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  48.61 
 
 		 652 aa  601  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  48.3 
 
 		 632 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  48.15 
 
 		 632 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  48.9 
 
 		 634 aa  595  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  48.15 
 
 		 632 aa  598  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  47.38 
 
 		 632 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  47.61 
 
 		 630 aa  598  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5294  heat shock protein 90  47.66 
 
 		 636 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  47.57 
 
 		 623 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  49.29 
 
 		 634 aa  591  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  47.67 
 
 		 635 aa  589  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  46.48 
 
 		 638 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  47.42 
 
 		 623 aa  588  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  46.14 
 
 		 637 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  47.42 
 
 		 624 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  47.42 
 
 		 624 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  47.42 
 
 		 624 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  47.42 
 
 		 624 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  47.42 
 
 		 624 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  48.21 
 
 		 628 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  47.42 
 
 		 624 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  48.04 
 
 		 634 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  47.15 
 
 		 632 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  47.42 
 
 		 624 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  48.61 
 
 		 629 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  47.42 
 
 		 624 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  45.85 
 
 		 638 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4676  heat shock protein 90  46.09 
 
 		 657 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2849  heat shock protein 90  45.44 
 
 		 638 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000520054  decreased coverage  0.00000000518986 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  48.61 
 
 		 629 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  47.42 
 
 		 624 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  47.34 
 
 		 633 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  48.04 
 
 		 634 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  46.18 
 
 		 622 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2743  heat shock protein Hsp90  46.68 
 
 		 677 aa  579  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  47.73 
 
 		 634 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  46.53 
 
 		 632 aa  581  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  46.69 
 
 		 632 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  46.18 
 
 		 624 aa  578  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  48.2 
 
 		 634 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  46.97 
 
 		 643 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  46.18 
 
 		 624 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  47 
 
 		 632 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  47 
 
 		 632 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  47.12 
 
 		 643 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  47.96 
 
 		 634 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  47 
 
 		 632 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  46.64 
 
 		 624 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  46.49 
 
 		 626 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  45 
 
 		 637 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  46.64 
 
 		 624 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2894  heat shock protein 90  46 
 
 		 640 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.511153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  48.75 
 
 		 634 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  46.64 
 
 		 624 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  46.64 
 
 		 624 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  45.7 
 
 		 637 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  47.81 
 
 		 634 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  44.91 
 
 		 637 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  44.91 
 
 		 637 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20340  heat shock protein 90  47.38 
 
 		 644 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  46.48 
 
 		 624 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  46.69 
 
 		 632 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01104  heat shock protein 90  46.42 
 
 		 640 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436583  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  45.4 
 
 		 639 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  45.07 
 
 		 637 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  45.38 
 
 		 637 aa  571  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  47.18 
 
 		 635 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  46.97 
 
 		 633 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>