More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1779 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1779  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
613 aa  1258    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1831  HSP90 family protein  37.23 
 
 
646 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5466  HSP90 family protein  39.14 
 
 
585 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  37.46 
 
 
589 aa  399  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0695  HSP90 family protein  36.11 
 
 
643 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0495  ATP-binding region ATPase domain protein  36.26 
 
 
598 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0267  HSP90 family protein  34.76 
 
 
661 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.979719  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2987  ATP-binding region ATPase domain protein  33.39 
 
 
622 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23120  molecular chaperone of HSP90 family  32.56 
 
 
641 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.139471 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2463  HSP90 family protein  31.8 
 
 
621 aa  286  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0779682  decreased coverage  0.00689697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4376  HSP90 family molecular chaperone-like  26.36 
 
 
838 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4377  ATPase domain-containing protein  26.07 
 
 
594 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5718  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  27.54 
 
 
872 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.903577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01954  Hsp90xo protein  25.57 
 
 
622 aa  141  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4279  Hsp90xo protein  30.1 
 
 
608 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4284  hypothetical protein  27.44 
 
 
611 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4309  HSP90 family protein  25.49 
 
 
617 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50590  HSP90 family protein  26.57 
 
 
636 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1146  Hsp90xo protein  26 
 
 
618 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  24.72 
 
 
627 aa  126  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3230  heat shock protein 90  24.42 
 
 
614 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1273  heat shock protein 90  23.97 
 
 
625 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1573  heat shock protein 90  24.69 
 
 
628 aa  121  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534584  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18793  predicted protein  25.12 
 
 
750 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1195  heat shock protein 90  25.25 
 
 
628 aa  117  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1071  heat shock protein 90  24.13 
 
 
629 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  26.56 
 
 
606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1188  heat shock protein 90  25.62 
 
 
626 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1549  heat shock protein 90  23.98 
 
 
630 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2376  heat shock protein 90  22.85 
 
 
627 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175392  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2002  heat shock protein 90  25.67 
 
 
613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.240397 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  24.14 
 
 
633 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  23.11 
 
 
650 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  24.2 
 
 
623 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  23.84 
 
 
650 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  24.36 
 
 
611 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4168  heat shock protein 90  24.04 
 
 
629 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.160009  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  22.52 
 
 
629 aa  110  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1910  heat shock protein 90  24.19 
 
 
650 aa  109  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  23.08 
 
 
622 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  23.08 
 
 
624 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  23.08 
 
 
624 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  24.87 
 
 
611 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  22.29 
 
 
629 aa  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1404  heat shock protein 90  22.06 
 
 
634 aa  107  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.898305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  25.75 
 
 
610 aa  107  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_55215  heat shock protein Hsp90  24.53 
 
 
780 aa  106  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0117  heat shock protein 90  24.28 
 
 
631 aa  105  3e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  23.15 
 
 
652 aa  105  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1472  heat shock protein 90  24.29 
 
 
615 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  24.07 
 
 
630 aa  105  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01327  heat shock protein 90  22.12 
 
 
634 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  24.11 
 
 
645 aa  104  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  24.65 
 
 
633 aa  103  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  23.77 
 
 
623 aa  103  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1006  heat shock protein 90  24.11 
 
 
612 aa  103  9e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.511721  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  24.65 
 
 
633 aa  103  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  24.73 
 
 
644 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2480  heat shock protein 90  21.83 
 
 
640 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  22.75 
 
 
657 aa  103  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  24.37 
 
 
640 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  22.73 
 
 
623 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1728  heat shock protein 90  22.32 
 
 
645 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000167687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1803  heat shock protein 90  23.85 
 
 
644 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  24.53 
 
 
632 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20340  heat shock protein 90  25.28 
 
 
644 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  21.62 
 
 
639 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  22.71 
 
 
642 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  21.69 
 
 
624 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1800  heat shock protein Hsp90  24.94 
 
 
646 aa  102  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  21.73 
 
 
637 aa  102  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4301  heat shock protein 90  24.19 
 
 
627 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  25.06 
 
 
624 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  23.69 
 
 
644 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  22.57 
 
 
629 aa  100  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2474  heat shock protein 90  24.34 
 
 
636 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0369006  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  22.95 
 
 
634 aa  100  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004137  chaperone protein HtpG  22 
 
 
634 aa  99.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1082  heat shock protein 90  23.27 
 
 
634 aa  99.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1147  heat shock protein 90  23.12 
 
 
636 aa  100  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30595  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  22.34 
 
 
626 aa  100  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  23.71 
 
 
631 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  22.57 
 
 
635 aa  99  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0752  heat shock protein 90  22.06 
 
 
633 aa  99.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0322  heat shock protein 90  24.7 
 
 
624 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2743  heat shock protein Hsp90  24.17 
 
 
677 aa  98.6  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  21.39 
 
 
638 aa  98.2  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2657  heat shock protein 90  25.21 
 
 
636 aa  98.6  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0502417  hitchhiker  0.00031577 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  24.39 
 
 
633 aa  98.6  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13490  heat shock protein 90  26.24 
 
 
632 aa  98.2  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1998  heat shock protein 90  25.41 
 
 
666 aa  98.2  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.154063  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  29.55 
 
 
626 aa  98.2  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0607  heat shock protein 90  23.78 
 
 
637 aa  98.2  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09601  heat shock protein 90  23.33 
 
 
634 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.237308  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  21.82 
 
 
624 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4929  heat shock protein 90  23.96 
 
 
620 aa  97.8  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.621243 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  21.82 
 
 
624 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  21.82 
 
 
624 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  21.82 
 
 
624 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  21.82 
 
 
624 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>