194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0893 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 975 aa  2014    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  33.62 
 
 		 1178 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  33.9 
 
 		 1178 aa  452  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  31.49 
 
 		 1176 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  31.64 
 
 		 1171 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  31.13 
 
 		 1190 aa  402  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  42.23 
 
 		 914 aa  308  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  28.97 
 
 		 1185 aa  281  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  35.34 
 
 		 1062 aa  204  8e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  31.84 
 
 		 1335 aa  178  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  26.07 
 
 		 1132 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  29.67 
 
 		 925 aa  102  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  25.51 
 
 		 958 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.56 
 
 		 1203 aa  96.3  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1220 aa  93.6  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.93 
 
 		 1196 aa  91.3  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  24.31 
 
 		 1056 aa  88.2  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  25.32 
 
 		 1490 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1100 aa  83.2  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  28.86 
 
 		 1099 aa  82  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  26.13 
 
 		 549 aa  81.6  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  26.71 
 
 		 1094 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1126 aa  80.1  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  25.63 
 
 		 629 aa  79.7  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1049 aa  78.6  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  27.49 
 
 		 1622 aa  78.2  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  27.94 
 
 		 914 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  23.75 
 
 		 1087 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  29.93 
 
 		 1790 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.51 
 
 		 932 aa  76.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.71 
 
 		 605 aa  76.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  26.57 
 
 		 1002 aa  75.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  28.52 
 
 		 797 aa  75.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  29.35 
 
 		 1489 aa  75.1  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1126 aa  75.1  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  25.81 
 
 		 758 aa  74.7  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.38 
 
 		 1477 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  24.76 
 
 		 1157 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  23.68 
 
 		 946 aa  72  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  28.48 
 
 		 585 aa  72  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  25.7 
 
 		 759 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  26.53 
 
 		 1630 aa  71.6  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  26.48 
 
 		 904 aa  70.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1092 aa  70.9  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  24.48 
 
 		 1061 aa  70.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  24.48 
 
 		 906 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  26.07 
 
 		 759 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  26.6 
 
 		 922 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  27.16 
 
 		 916 aa  69.7  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.93 
 
 		 1164 aa  68.6  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  26.07 
 
 		 759 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  25.38 
 
 		 1620 aa  67.8  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  25.89 
 
 		 759 aa  67.4  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  25.7 
 
 		 759 aa  67.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  25.77 
 
 		 759 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  25.77 
 
 		 759 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  25.89 
 
 		 759 aa  67.4  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  25.39 
 
 		 769 aa  67.4  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  25.77 
 
 		 759 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  23.29 
 
 		 905 aa  67.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  22.88 
 
 		 905 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1018 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  25.49 
 
 		 928 aa  65.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  25.77 
 
 		 1585 aa  65.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  26.63 
 
 		 1585 aa  65.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  21.02 
 
 		 903 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  22.78 
 
 		 905 aa  65.1  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  24.5 
 
 		 908 aa  65.1  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  24.3 
 
 		 769 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.15 
 
 		 1363 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1822 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  23.92 
 
 		 633 aa  62.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  24.38 
 
 		 900 aa  62.4  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  23.94 
 
 		 905 aa  62  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  23.94 
 
 		 905 aa  62  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  25.52 
 
 		 1575 aa  62  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  24.39 
 
 		 1296 aa  61.6  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  23.7 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  24.38 
 
 		 907 aa  61.6  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  24.19 
 
 		 1973 aa  61.2  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  24.36 
 
 		 1090 aa  61.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  24.15 
 
 		 1557 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1801 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  29.94 
 
 		 1077 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  24.32 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1116 aa  59.7  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1126 aa  59.3  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.36 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1652 aa  58.5  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  24.71 
 
 		 1048 aa  58.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  27.15 
 
 		 553 aa  57.4  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  27.15 
 
 		 553 aa  57.4  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  26.96 
 
 		 1038 aa  57.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  23.67 
 
 		 934 aa  56.6  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24 
 
 		 636 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  22.22 
 
 		 902 aa  56.2  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1474 aa  56.2  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  25.32 
 
 		 650 aa  55.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  24.13 
 
 		 941 aa  56.2  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  23.55 
 
 		 633 aa  56.2  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>