102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1989 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  100 
 
 		 605 aa  1250    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  37.5 
 
 		 549 aa  277  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  38.12 
 
 		 1164 aa  276  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1126 aa  264  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  34.27 
 
 		 1100 aa  263  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  35.27 
 
 		 1056 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  34.39 
 
 		 1220 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  36.39 
 
 		 1049 aa  248  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  34 
 
 		 1126 aa  244  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  30.35 
 
 		 1061 aa  236  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  34.16 
 
 		 1157 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  34.17 
 
 		 1087 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  33.66 
 
 		 1094 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  35.57 
 
 		 1477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1092 aa  217  5e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  27.54 
 
 		 1132 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  27.21 
 
 		 958 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.73 
 
 		 1196 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  22.87 
 
 		 1178 aa  88.2  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  26.44 
 
 		 1171 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  22.87 
 
 		 1178 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  24.92 
 
 		 1620 aa  81.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  23.19 
 
 		 914 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1176 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  24.71 
 
 		 975 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  25.68 
 
 		 1190 aa  75.1  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  24.01 
 
 		 1185 aa  74.3  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25.61 
 
 		 609 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  24.77 
 
 		 1335 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  22.88 
 
 		 932 aa  68.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.51 
 
 		 1203 aa  67.8  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  21.32 
 
 		 946 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  24.87 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  24.87 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  26.09 
 
 		 748 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  23.25 
 
 		 922 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  23.78 
 
 		 1090 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  24.75 
 
 		 619 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  23.12 
 
 		 902 aa  58.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  24.75 
 
 		 622 aa  57.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  28.08 
 
 		 1077 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  22.73 
 
 		 1002 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  23.15 
 
 		 651 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  24.01 
 
 		 941 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  24.75 
 
 		 622 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.76 
 
 		 636 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  23.43 
 
 		 1196 aa  55.1  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  22.88 
 
 		 1559 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  23.28 
 
 		 925 aa  53.9  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  21.43 
 
 		 901 aa  52.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  23.13 
 
 		 916 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2810  hypothetical protein  29.07 
 
 		 985 aa  52  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  24.46 
 
 		 1585 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  24.46 
 
 		 1585 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  25.33 
 
 		 2002 aa  50.4  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  22.12 
 
 		 611 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  28.21 
 
 		 797 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  35.94 
 
 		 1622 aa  50.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1854 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1888 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  22.5 
 
 		 606 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  52.38 
 
 		 1980 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  22.84 
 
 		 902 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  54.05 
 
 		 1801 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 		 1973 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  21.77 
 
 		 1584 aa  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1018 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  26.19 
 
 		 2123 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  24.24 
 
 		 715 aa  47.8  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  47.37 
 
 		 1722 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1572 aa  47.4  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  24.24 
 
 		 633 aa  47.4  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  21.56 
 
 		 1099 aa  47.4  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  25.55 
 
 		 1189 aa  47.4  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  26.47 
 
 		 1861 aa  47.4  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  30.26 
 
 		 1284 aa  47  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  24.58 
 
 		 1877 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  22.09 
 
 		 2759 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1062 aa  47  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  21.45 
 
 		 934 aa  47  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  22.19 
 
 		 1296 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  23.29 
 
 		 1950 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  22.76 
 
 		 1121 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  45.95 
 
 		 2045 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  23.29 
 
 		 1958 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  22.29 
 
 		 1408 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  21.38 
 
 		 1118 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  22.96 
 
 		 928 aa  46.2  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  20.89 
 
 		 906 aa  45.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  21.34 
 
 		 1215 aa  45.8  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  21.86 
 
 		 716 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  22.89 
 
 		 1081 aa  45.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  25.76 
 
 		 1367 aa  44.7  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  31.2 
 
 		 2013 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  20.71 
 
 		 643 aa  44.3  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1215 aa  44.3  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1904 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  22.26 
 
 		 659 aa  43.9  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  20.75 
 
 		 914 aa  43.9  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  41.3 
 
 		 1945 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>