117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00472 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  100 
 
 		 1049 aa  2152    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  34.18 
 
 		 1126 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1100 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.4 
 
 		 1164 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1220 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  39.23 
 
 		 549 aa  271  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  40 
 
 		 1126 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  36.63 
 
 		 605 aa  248  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  40.25 
 
 		 1157 aa  245  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  38.4 
 
 		 1056 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  36.32 
 
 		 1094 aa  231  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  35.11 
 
 		 1087 aa  229  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  35.64 
 
 		 1061 aa  207  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.45 
 
 		 1477 aa  204  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1898  hypothetical protein  29.58 
 
 		 498 aa  183  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170657 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  31.7 
 
 		 1092 aa  182  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.3 
 
 		 1196 aa  102  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  27.72 
 
 		 1171 aa  88.6  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  24.6 
 
 		 1132 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  25.15 
 
 		 958 aa  81.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  24.04 
 
 		 1185 aa  80.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  24.84 
 
 		 1002 aa  79.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1176 aa  79.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  27.2 
 
 		 975 aa  78.2  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  23.45 
 
 		 1178 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23060  hypothetical protein  44.74 
 
 		 178 aa  77.4  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  24.26 
 
 		 1190 aa  75.9  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0412  hypothetical protein  31.69 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.629297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  25.07 
 
 		 914 aa  73.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  23.51 
 
 		 636 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  25.13 
 
 		 1178 aa  72  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  26.13 
 
 		 946 aa  71.6  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.79 
 
 		 1203 aa  70.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  26.26 
 
 		 635 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  25.07 
 
 		 1620 aa  67  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.09 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  26.02 
 
 		 759 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2810  hypothetical protein  39.05 
 
 		 985 aa  64.3  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  23.17 
 
 		 632 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  25.39 
 
 		 769 aa  63.9  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  25.71 
 
 		 759 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  25.71 
 
 		 759 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  27.52 
 
 		 1335 aa  62.4  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1062 aa  62.4  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  25.71 
 
 		 759 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  25.39 
 
 		 759 aa  62  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  25.71 
 
 		 759 aa  62  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  25.39 
 
 		 759 aa  62  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  25.39 
 
 		 759 aa  62.4  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  25.51 
 
 		 629 aa  61.2  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  25.71 
 
 		 759 aa  60.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  22.19 
 
 		 932 aa  60.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  26.97 
 
 		 1490 aa  59.7  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  25.35 
 
 		 2013 aa  58.2  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  23.77 
 
 		 769 aa  57.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  24.92 
 
 		 902 aa  57.4  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  22.64 
 
 		 922 aa  57.4  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  24.21 
 
 		 925 aa  57.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  26.69 
 
 		 941 aa  57  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  23.32 
 
 		 1296 aa  56.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  25.86 
 
 		 2016 aa  56.2  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  22.78 
 
 		 1077 aa  55.8  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.75 
 
 		 1403 aa  55.5  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  21.76 
 
 		 1097 aa  55.5  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  25.5 
 
 		 901 aa  55.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1018 aa  54.7  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  22.19 
 
 		 1888 aa  54.7  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  31.09 
 
 		 2045 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25.08 
 
 		 609 aa  52.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  22.35 
 
 		 906 aa  52.4  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  22.5 
 
 		 916 aa  52  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.79 
 
 		 752 aa  51.6  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  23.59 
 
 		 1090 aa  51.2  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  23.49 
 
 		 986 aa  50.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  20.79 
 
 		 1099 aa  51.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  23.61 
 
 		 606 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1652 aa  51.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  37.66 
 
 		 1861 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  21.76 
 
 		 611 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  24.54 
 
 		 1593 aa  50.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1722 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  25.4 
 
 		 754 aa  50.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  26.3 
 
 		 934 aa  49.3  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  23.12 
 
 		 1585 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  24.51 
 
 		 908 aa  49.7  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  23 
 
 		 797 aa  49.7  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  22.19 
 
 		 1328 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  23.12 
 
 		 1585 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  24.66 
 
 		 928 aa  49.7  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.51 
 
 		 585 aa  49.3  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  32.95 
 
 		 2123 aa  49.3  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  39.06 
 
 		 1589 aa  49.3  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  39.06 
 
 		 1589 aa  49.3  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  24.67 
 
 		 622 aa  49.3  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  26.1 
 
 		 900 aa  48.9  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  41.94 
 
 		 1559 aa  48.9  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  24.17 
 
 		 1367 aa  48.5  0.0006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  26.1 
 
 		 907 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1572 aa  47.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  37.5 
 
 		 1589 aa  47.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>