75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2785 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  100 
 
 
1477 aa  3093    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  28.54 
 
 
1220 aa  293  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  24.66 
 
 
1056 aa  276  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  27.96 
 
 
1087 aa  259  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  27.26 
 
 
1094 aa  257  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  27.57 
 
 
1092 aa  245  5e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  35.1 
 
 
1164 aa  229  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  35.57 
 
 
605 aa  221  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  35.36 
 
 
1100 aa  221  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  34.19 
 
 
1157 aa  216  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  35.11 
 
 
549 aa  214  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  33.17 
 
 
1126 aa  213  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  34.69 
 
 
1126 aa  205  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  34.33 
 
 
1061 aa  204  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  32.45 
 
 
1049 aa  204  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  24.56 
 
 
1335 aa  94.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  26.82 
 
 
1185 aa  93.6  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1898  hypothetical protein  42.96 
 
 
498 aa  90.5  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170657 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  26.68 
 
 
958 aa  89  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.89 
 
 
1196 aa  89  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  24.22 
 
 
1132 aa  87  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  20.75 
 
 
1176 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  24.08 
 
 
903 aa  75.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  23.38 
 
 
975 aa  73.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23060  hypothetical protein  40.38 
 
 
178 aa  73.6  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  23.6 
 
 
1178 aa  73.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  25.09 
 
 
946 aa  69.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0412  hypothetical protein  35.2 
 
 
308 aa  66.6  0.000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.629297  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  22.1 
 
 
1062 aa  66.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.92 
 
 
1203 aa  65.9  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  23.18 
 
 
1171 aa  63.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  25.25 
 
 
1190 aa  63.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  21.52 
 
 
1178 aa  61.6  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  21.15 
 
 
1090 aa  57.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  22.56 
 
 
1002 aa  56.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  22.42 
 
 
914 aa  56.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  24.68 
 
 
754 aa  56.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  23.75 
 
 
906 aa  56.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  39.71 
 
 
1861 aa  53.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  36.76 
 
 
1571 aa  52.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  34.88 
 
 
1559 aa  52  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  35.29 
 
 
1593 aa  51.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  40.32 
 
 
1854 aa  50.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  35.29 
 
 
1904 aa  50.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.932942 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  19.75 
 
 
1077 aa  51.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  25.71 
 
 
1697 aa  50.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  24.11 
 
 
1099 aa  50.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  26.27 
 
 
1284 aa  50.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  24.66 
 
 
553 aa  50.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  24.66 
 
 
553 aa  50.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  22.15 
 
 
769 aa  50.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  34.78 
 
 
1722 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  24.75 
 
 
633 aa  49.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  23.61 
 
 
1584 aa  49.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  21.86 
 
 
932 aa  48.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  21.62 
 
 
1622 aa  48.9  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  36.23 
 
 
1559 aa  48.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  35.42 
 
 
2045 aa  48.5  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  25.09 
 
 
635 aa  48.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  35.53 
 
 
1853 aa  48.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  22.36 
 
 
633 aa  48.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  23.66 
 
 
1215 aa  48.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  22.38 
 
 
479 aa  47.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  23.13 
 
 
632 aa  47.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  24.04 
 
 
633 aa  47.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  20.3 
 
 
1403 aa  47.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  36.84 
 
 
902 aa  47.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  34.12 
 
 
629 aa  47  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  36.76 
 
 
1877 aa  47  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  25 
 
 
636 aa  46.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  21.74 
 
 
633 aa  46.2  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  33.33 
 
 
2096 aa  46.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  24.56 
 
 
905 aa  45.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  30.61 
 
 
585 aa  45.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  23.87 
 
 
908 aa  45.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>