81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4016 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  100 
 
 		 1100 aa  2272    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  36.07 
 
 		 1126 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.9 
 
 		 1164 aa  554  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1126 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  45.88 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  32.59 
 
 		 1049 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  32.15 
 
 		 1094 aa  362  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  32.22 
 
 		 1157 aa  357  7.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1898  hypothetical protein  40.53 
 
 		 498 aa  346  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  39.52 
 
 		 1087 aa  273  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  40.38 
 
 		 1056 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.27 
 
 		 605 aa  263  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  38.56 
 
 		 1220 aa  241  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  35.36 
 
 		 1477 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  37.63 
 
 		 1092 aa  217  9e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  37.1 
 
 		 1061 aa  210  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  27.18 
 
 		 1132 aa  94.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23060  hypothetical protein  50.53 
 
 		 178 aa  83.6  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  27.51 
 
 		 975 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 		 958 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  28.03 
 
 		 1178 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  25.85 
 
 		 1185 aa  81.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1176 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  26.15 
 
 		 1178 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0412  hypothetical protein  29.8 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.629297  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  27.87 
 
 		 1171 aa  77.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.99 
 
 		 1196 aa  77  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  26.98 
 
 		 1335 aa  76.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1062 aa  75.1  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  25.34 
 
 		 914 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  26.8 
 
 		 946 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  24.47 
 
 		 1190 aa  72.4  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  23 
 
 		 1002 aa  72  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  23.58 
 
 		 1620 aa  68.6  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.73 
 
 		 922 aa  63.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.48 
 
 		 932 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  24.09 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  23.55 
 
 		 632 aa  61.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  24.76 
 
 		 2096 aa  58.9  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  26.28 
 
 		 622 aa  58.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 		 903 aa  58.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  25.41 
 
 		 916 aa  57.4  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  23.08 
 
 		 754 aa  57.4  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1572 aa  57.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2810  hypothetical protein  44.44 
 
 		 985 aa  57  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  25.74 
 
 		 619 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  25.44 
 
 		 2005 aa  55.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  21.62 
 
 		 1099 aa  55.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  25.6 
 
 		 622 aa  54.7  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  22.64 
 
 		 609 aa  53.5  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.65 
 
 		 1203 aa  53.5  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  44.26 
 
 		 1722 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.12 
 
 		 752 aa  52  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1888 aa  52  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  23.39 
 
 		 925 aa  51.6  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  22.7 
 
 		 629 aa  51.6  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  23.94 
 
 		 2045 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  22.67 
 
 		 1038 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  21.75 
 
 		 1403 aa  50.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  22.68 
 
 		 797 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  23.78 
 
 		 906 aa  50.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  27.48 
 
 		 636 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  21.16 
 
 		 635 aa  50.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  23.53 
 
 		 611 aa  49.7  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  46.88 
 
 		 1861 aa  48.9  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  22.86 
 
 		 1653 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  24.14 
 
 		 651 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  21.8 
 
 		 636 aa  48.5  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  23.7 
 
 		 1090 aa  48.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  23.49 
 
 		 941 aa  47.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1116 aa  47.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  20.84 
 
 		 1622 aa  47  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  21.58 
 
 		 901 aa  46.2  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  23.55 
 
 		 1999 aa  46.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  32.67 
 
 		 1559 aa  45.8  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  23.2 
 
 		 479 aa  46.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23.05 
 
 		 1077 aa  46.2  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  22.11 
 
 		 902 aa  45.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  22.16 
 
 		 1651 aa  45.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  25.38 
 
 		 905 aa  45.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  27.44 
 
 		 315 aa  45.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>