189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3665 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  47.06 
 
 		 2125 aa  1592    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  100 
 
 		 2005 aa  3896    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  47.06 
 
 		 2125 aa  1592    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  32.18 
 
 		 1980 aa  644    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  34.06 
 
 		 2222 aa  369  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  36.03 
 
 		 1803 aa  361  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  33.62 
 
 		 2013 aa  358  5.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  36.08 
 
 		 2207 aa  357  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  34.02 
 
 		 2204 aa  355  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  35.02 
 
 		 1991 aa  350  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  33.49 
 
 		 1958 aa  348  6e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  33.45 
 
 		 2197 aa  347  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  32.75 
 
 		 2198 aa  344  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  31.75 
 
 		 1950 aa  343  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  35.6 
 
 		 2016 aa  342  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  33.95 
 
 		 1945 aa  342  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  32.94 
 
 		 1986 aa  339  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  31.74 
 
 		 1958 aa  338  5.999999999999999e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  39.53 
 
 		 2002 aa  335  8e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  37.74 
 
 		 1754 aa  329  4.0000000000000003e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  32.86 
 
 		 1959 aa  324  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  36.09 
 
 		 1572 aa  323  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  35.31 
 
 		 1888 aa  323  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  33.54 
 
 		 1973 aa  322  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  31.22 
 
 		 1575 aa  318  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  32.52 
 
 		 1867 aa  315  6.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  35.32 
 
 		 1622 aa  314  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  31.59 
 
 		 1983 aa  313  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  29.21 
 
 		 2759 aa  313  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  31.34 
 
 		 1593 aa  302  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1823 aa  290  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  34.1 
 
 		 1877 aa  288  8e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  29.86 
 
 		 1559 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  33.23 
 
 		 1854 aa  285  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  30.64 
 
 		 1853 aa  283  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  34.8 
 
 		 1589 aa  274  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  33.23 
 
 		 1589 aa  271  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.15 
 
 		 1403 aa  270  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1328 aa  269  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  33.07 
 
 		 1589 aa  268  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  36.33 
 
 		 2045 aa  265  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  33.84 
 
 		 2096 aa  264  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  37.96 
 
 		 1571 aa  263  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  34.43 
 
 		 1861 aa  258  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  38.33 
 
 		 1559 aa  258  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1801 aa  251  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  34.84 
 
 		 1722 aa  248  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  36.76 
 
 		 2123 aa  245  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  32.92 
 
 		 1904 aa  238  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  37.34 
 
 		 1838 aa  226  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  35.15 
 
 		 1822 aa  223  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  37.25 
 
 		 1363 aa  221  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  31.05 
 
 		 1822 aa  215  9e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  39.48 
 
 		 1328 aa  211  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  35.06 
 
 		 1296 aa  196  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  39.38 
 
 		 2098 aa  189  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  38.92 
 
 		 2098 aa  189  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 		 2104 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 2101 aa  182  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 2101 aa  182  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 2098 aa  181  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.29 
 
 		 1312 aa  181  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  29.78 
 
 		 1367 aa  147  2e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  30.94 
 
 		 1285 aa  138  9.999999999999999e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1939  DNA helicase-related protein  28.82 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  26.59 
 
 		 1050 aa  104  2e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  27.42 
 
 		 906 aa  103  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  27.53 
 
 		 905 aa  100  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  29.21 
 
 		 905 aa  99.4  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  29.34 
 
 		 905 aa  97.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1407 aa  96.7  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  29.06 
 
 		 900 aa  96.7  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  29.06 
 
 		 907 aa  95.5  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  29.91 
 
 		 905 aa  95.1  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  29.91 
 
 		 905 aa  95.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  29.47 
 
 		 908 aa  95.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  29.53 
 
 		 903 aa  94.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1506 aa  92  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1413 aa  92  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  25.56 
 
 		 1697 aa  89.7  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  28.4 
 
 		 1557 aa  89  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1400 aa  88.6  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0035  hypothetical protein  34.36 
 
 		 374 aa  87  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  27.88 
 
 		 1629 aa  86.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1392 aa  84.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  27.34 
 
 		 1790 aa  84.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  27.14 
 
 		 1410 aa  81.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.54 
 
 		 1203 aa  79.7  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  26.95 
 
 		 1649 aa  78.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  27.71 
 
 		 1630 aa  77.8  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1499 aa  77.4  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1254 aa  73.6  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  28.21 
 
 		 1622 aa  73.2  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  27.06 
 
 		 1489 aa  72.8  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1724 aa  72.4  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  25.35 
 
 		 925 aa  69.7  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  30.72 
 
 		 946 aa  69.7  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  27.7 
 
 		 1575 aa  69.3  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  29.08 
 
 		 466 aa  68.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  25.65 
 
 		 1490 aa  67.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>