203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1551 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  100 
 
 
1403 aa  2885    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  28.78 
 
 
1328 aa  463  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  42.71 
 
 
1622 aa  381  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  28.27 
 
 
1822 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  37.73 
 
 
2197 aa  345  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  40 
 
 
2207 aa  344  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  38.24 
 
 
2204 aa  340  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  39.79 
 
 
1803 aa  340  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  35.15 
 
 
1328 aa  335  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  36.87 
 
 
1973 aa  332  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  38.32 
 
 
2016 aa  330  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  38.78 
 
 
1823 aa  327  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  34.81 
 
 
2013 aa  326  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  37.83 
 
 
1958 aa  325  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  38.29 
 
 
2198 aa  325  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  37.82 
 
 
1945 aa  325  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  35.92 
 
 
1980 aa  324  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  37.7 
 
 
2222 aa  321  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  36.88 
 
 
1867 aa  320  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  33.14 
 
 
2045 aa  319  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  29.84 
 
 
1575 aa  318  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  34.97 
 
 
1950 aa  317  7e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  35.1 
 
 
1958 aa  316  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  37.01 
 
 
1754 aa  315  3.9999999999999997e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  36.98 
 
 
1991 aa  315  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  35.52 
 
 
2759 aa  315  4.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  37.83 
 
 
1986 aa  313  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  36.2 
 
 
1983 aa  312  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  31.51 
 
 
2098 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  36.71 
 
 
2002 aa  310  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  37.02 
 
 
1854 aa  309  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  37.5 
 
 
1571 aa  308  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  31.51 
 
 
2098 aa  308  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  35.01 
 
 
1959 aa  308  6e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  33.81 
 
 
1363 aa  306  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  33.27 
 
 
1877 aa  303  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  37.94 
 
 
2125 aa  300  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  37.94 
 
 
2125 aa  300  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  37.95 
 
 
1559 aa  298  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  33.4 
 
 
1559 aa  296  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  36.85 
 
 
1853 aa  295  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  35.3 
 
 
1722 aa  295  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  35.08 
 
 
1888 aa  294  8e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  34.74 
 
 
1904 aa  292  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  32.31 
 
 
1593 aa  291  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  36.57 
 
 
2123 aa  290  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  34.09 
 
 
1801 aa  287  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  36.15 
 
 
1296 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  35.9 
 
 
1838 aa  278  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  34.96 
 
 
2005 aa  277  9e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  34.6 
 
 
1861 aa  274  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  35.22 
 
 
2101 aa  272  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  35.22 
 
 
2101 aa  272  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
2104 aa  270  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  34.64 
 
 
2096 aa  269  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 
2098 aa  269  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  34.73 
 
 
1572 aa  269  4e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  33.81 
 
 
1589 aa  268  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  33.61 
 
 
1589 aa  267  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  33.68 
 
 
1589 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  32.68 
 
 
1822 aa  266  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.75 
 
 
1312 aa  238  6e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  32.34 
 
 
1367 aa  204  9.999999999999999e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  35.96 
 
 
1285 aa  184  1e-44  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  28.31 
 
 
1790 aa  141  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  27.87 
 
 
1697 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  27.97 
 
 
1630 aa  137  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1076  hypothetical protein  41.36 
 
 
194 aa  137  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000229233  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  29.19 
 
 
1649 aa  134  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  28.84 
 
 
1474 aa  132  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  28.98 
 
 
1622 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  29.17 
 
 
1490 aa  129  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  25.05 
 
 
1412 aa  127  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  27.73 
 
 
1629 aa  125  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  25.41 
 
 
1392 aa  124  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  26.03 
 
 
1652 aa  124  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  27.33 
 
 
1410 aa  122  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  26.43 
 
 
1050 aa  122  3.9999999999999996e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  27.78 
 
 
1489 aa  122  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  21.97 
 
 
1413 aa  121  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  26.81 
 
 
1575 aa  119  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  25 
 
 
1121 aa  113  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  27.77 
 
 
1523 aa  107  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  24.94 
 
 
1387 aa  100  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  22.42 
 
 
1499 aa  97.8  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  27.51 
 
 
946 aa  98.2  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  25.58 
 
 
1694 aa  96.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  26.05 
 
 
1724 aa  96.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  26.62 
 
 
2622 aa  94.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  25.96 
 
 
906 aa  93.2  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 
903 aa  92.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  23.02 
 
 
1081 aa  92  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  23.4 
 
 
1407 aa  85.1  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.09 
 
 
1196 aa  84.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  23.06 
 
 
1400 aa  81.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  24.58 
 
 
1506 aa  81.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  26.97 
 
 
1557 aa  80.9  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.6 
 
 
629 aa  80.1  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  23.3 
 
 
905 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  26.89 
 
 
1185 aa  78.6  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>