167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2163 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  37.1 
 
 		 1822 aa  1204    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  37.88 
 
 		 1838 aa  1171    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  100 
 
 		 1822 aa  3771    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  34.72 
 
 		 1559 aa  282  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  32.92 
 
 		 1973 aa  268  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  35.12 
 
 		 2016 aa  267  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  32.15 
 
 		 1888 aa  265  6.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1722 aa  264  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1854 aa  264  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  32.97 
 
 		 2759 aa  263  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  32.47 
 
 		 1861 aa  262  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  32.23 
 
 		 1572 aa  259  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1328 aa  259  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  33.46 
 
 		 1575 aa  258  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  33.98 
 
 		 1754 aa  256  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1904 aa  256  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  31.4 
 
 		 1877 aa  253  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  33.47 
 
 		 1622 aa  253  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  33.54 
 
 		 2204 aa  253  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  32.55 
 
 		 2222 aa  252  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  33.27 
 
 		 1867 aa  251  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.68 
 
 		 1403 aa  251  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  33.06 
 
 		 2197 aa  248  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  33.39 
 
 		 1950 aa  247  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  31.41 
 
 		 1958 aa  247  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  33.39 
 
 		 1958 aa  247  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  31.14 
 
 		 2045 aa  246  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  31.7 
 
 		 1853 aa  245  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  33.27 
 
 		 2198 aa  245  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  32.72 
 
 		 1823 aa  245  7e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  33.53 
 
 		 1945 aa  244  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  33.2 
 
 		 1991 aa  241  8e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  32.72 
 
 		 2207 aa  241  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  32.14 
 
 		 1589 aa  241  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1589 aa  240  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  30.91 
 
 		 1803 aa  239  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1589 aa  239  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  30.71 
 
 		 1986 aa  234  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1801 aa  233  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  31.41 
 
 		 2013 aa  231  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  32.87 
 
 		 1959 aa  231  9e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  32.51 
 
 		 1571 aa  231  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  31.79 
 
 		 1983 aa  229  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  28.68 
 
 		 1593 aa  223  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  30.08 
 
 		 1980 aa  219  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  27.37 
 
 		 2098 aa  218  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  32.85 
 
 		 2002 aa  217  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  29.5 
 
 		 2098 aa  217  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  27.47 
 
 		 2123 aa  213  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 		 2101 aa  210  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 		 2101 aa  210  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  31.64 
 
 		 1559 aa  210  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 		 2098 aa  207  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  30.6 
 
 		 2096 aa  207  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 		 2104 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  29.43 
 
 		 2125 aa  202  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  29.43 
 
 		 2125 aa  202  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  31.09 
 
 		 2005 aa  201  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  36.61 
 
 		 1296 aa  200  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  31.07 
 
 		 1363 aa  195  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  29.07 
 
 		 1328 aa  193  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.22 
 
 		 1312 aa  168  6.9999999999999995e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  34.77 
 
 		 1285 aa  164  1e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  28.9 
 
 		 1367 aa  163  3e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  27.46 
 
 		 1050 aa  107  2e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  24.1 
 
 		 1649 aa  97.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1652 aa  95.5  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  23.5 
 
 		 1629 aa  95.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  24.06 
 
 		 1490 aa  94.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  23.75 
 
 		 1622 aa  89.4  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  24.23 
 
 		 905 aa  89  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  24.74 
 
 		 905 aa  86.7  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  24.74 
 
 		 905 aa  86.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  28.31 
 
 		 1557 aa  86.3  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  23.98 
 
 		 905 aa  85.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  24.21 
 
 		 1489 aa  85.5  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  24.55 
 
 		 907 aa  85.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  26.45 
 
 		 1630 aa  84.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1407 aa  83.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  25.13 
 
 		 900 aa  83.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  23.53 
 
 		 905 aa  82.8  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  26.41 
 
 		 908 aa  81.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1400 aa  81.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  25.08 
 
 		 1790 aa  80.1  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  23.78 
 
 		 1121 aa  79.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  27.27 
 
 		 906 aa  79  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1474 aa  76.3  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  34.46 
 
 		 946 aa  72.8  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  21.12 
 
 		 1254 aa  71.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  20.51 
 
 		 1506 aa  70.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  23.67 
 
 		 1694 aa  69.7  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  21.96 
 
 		 1697 aa  69.3  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  21.86 
 
 		 1081 aa  69.3  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1670  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1207 aa  69.3  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  22.96 
 
 		 1410 aa  68.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  42.65 
 
 		 925 aa  67.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  26.89 
 
 		 606 aa  66.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  50.79 
 
 		 1264 aa  66.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  22.4 
 
 		 1523 aa  65.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  47.06 
 
 		 758 aa  65.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>