193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3203 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 2123 aa  4253    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  48.12 
 
 		 1801 aa  589  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  35.92 
 
 		 1722 aa  486  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  44.27 
 
 		 2096 aa  445  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  43.4 
 
 		 2045 aa  443  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  46.39 
 
 		 1904 aa  434  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  42.88 
 
 		 1861 aa  412  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1575 aa  407  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  43.88 
 
 		 1877 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  42.75 
 
 		 1853 aa  400  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  42.7 
 
 		 1823 aa  400  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  41.64 
 
 		 1854 aa  397  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  42.72 
 
 		 1593 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  40.63 
 
 		 1888 aa  387  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  46.04 
 
 		 1559 aa  385  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  38.52 
 
 		 2207 aa  384  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  40.54 
 
 		 1803 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  34.8 
 
 		 1622 aa  380  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  37.97 
 
 		 2197 aa  376  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  40.7 
 
 		 1945 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  42.65 
 
 		 1983 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  40.17 
 
 		 2016 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  41.07 
 
 		 1980 aa  374  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  45.72 
 
 		 1571 aa  374  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  40.89 
 
 		 1559 aa  370  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  39.57 
 
 		 2002 aa  367  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  40.36 
 
 		 2198 aa  365  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  39.3 
 
 		 1589 aa  364  8e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  41.1 
 
 		 2222 aa  363  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  39.11 
 
 		 1589 aa  362  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  38.18 
 
 		 1589 aa  362  6e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  41.27 
 
 		 2204 aa  361  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  42.08 
 
 		 1572 aa  360  9.999999999999999e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  41.67 
 
 		 1959 aa  355  5.9999999999999994e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  36.61 
 
 		 1958 aa  351  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  41.72 
 
 		 1986 aa  350  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  36.82 
 
 		 1973 aa  347  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  39.89 
 
 		 1867 aa  347  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  42.18 
 
 		 1950 aa  347  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  42.27 
 
 		 1958 aa  345  8e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  39.65 
 
 		 1991 aa  341  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  38.95 
 
 		 2759 aa  339  2.9999999999999997e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  40.98 
 
 		 1328 aa  339  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  37.84 
 
 		 1754 aa  336  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  38.16 
 
 		 2013 aa  327  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  36.29 
 
 		 1403 aa  290  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  36.62 
 
 		 2005 aa  252  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  33.93 
 
 		 1838 aa  237  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  33.84 
 
 		 2125 aa  231  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  33.84 
 
 		 2125 aa  231  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  34.06 
 
 		 1822 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  27.47 
 
 		 1822 aa  216  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30 
 
 		 1363 aa  194  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  30 
 
 		 1296 aa  191  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  33.05 
 
 		 1328 aa  191  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 		 2104 aa  181  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.24 
 
 		 1312 aa  178  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  30.02 
 
 		 2098 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  29.83 
 
 		 2101 aa  175  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  29.83 
 
 		 2101 aa  175  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  31.74 
 
 		 2098 aa  174  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  31.12 
 
 		 2098 aa  172  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  29.01 
 
 		 1367 aa  157  2e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1400 aa  140  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  28.42 
 
 		 1629 aa  134  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1407 aa  132  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  27.63 
 
 		 1412 aa  129  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  30.77 
 
 		 1285 aa  126  5e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  26.67 
 
 		 1649 aa  125  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1413 aa  119  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  29.5 
 
 		 1489 aa  117  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1474 aa  117  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1506 aa  115  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  29.5 
 
 		 1490 aa  115  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1652 aa  115  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  29.13 
 
 		 1050 aa  114  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  27.45 
 
 		 1575 aa  112  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  29 
 
 		 1523 aa  110  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1392 aa  110  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  27.64 
 
 		 1697 aa  107  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  27.78 
 
 		 1622 aa  105  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  27.67 
 
 		 1387 aa  105  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  27.66 
 
 		 1630 aa  103  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1076  hypothetical protein  35.98 
 
 		 194 aa  99.4  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000229233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  26.7 
 
 		 1410 aa  99  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  25.11 
 
 		 1790 aa  97.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1254 aa  90.5  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  26.37 
 
 		 2622 aa  89.4  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1724 aa  87.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  26.15 
 
 		 1694 aa  84  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1499 aa  82.4  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24380  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1670 aa  81.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694198  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3865  hypothetical protein  30.6 
 
 		 201 aa  80.1  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.62314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  26.5 
 
 		 903 aa  79.7  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  24.17 
 
 		 922 aa  79.3  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2393  NAD-dependent DNA ligase  26.64 
 
 		 216 aa  79  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  25.56 
 
 		 905 aa  77.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  27.04 
 
 		 906 aa  78.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.29 
 
 		 932 aa  77.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  25.56 
 
 		 905 aa  77.4  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>