79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  55.44 
 
 		 1506 aa  1254    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  60.9 
 
 		 1392 aa  1188    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  100 
 
 		 1413 aa  2738    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  57.22 
 
 		 1499 aa  1504    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  46.24 
 
 		 1412 aa  958    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  34.81 
 
 		 1400 aa  579  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1670  hypothetical protein  31.99 
 
 		 1207 aa  551  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1407 aa  548  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0229  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1252 aa  535  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24380  hypothetical protein  34.84 
 
 		 1670 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1254 aa  438  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3697  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1274 aa  258  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  26.03 
 
 		 1593 aa  163  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  28.16 
 
 		 2222 aa  162  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  28.9 
 
 		 2016 aa  160  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.85 
 
 		 1877 aa  160  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  26.7 
 
 		 2096 aa  159  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  24.06 
 
 		 2013 aa  156  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  28.01 
 
 		 1803 aa  155  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  26.91 
 
 		 1983 aa  154  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  26.64 
 
 		 1958 aa  154  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  26.25 
 
 		 2198 aa  154  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  28.68 
 
 		 1945 aa  153  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.69 
 
 		 1959 aa  153  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  24.31 
 
 		 1622 aa  152  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  26.09 
 
 		 2002 aa  152  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  26.47 
 
 		 2759 aa  152  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  25.18 
 
 		 2197 aa  152  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  26.22 
 
 		 1559 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1328 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1575 aa  149  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1854 aa  149  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  25.74 
 
 		 2207 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  28.35 
 
 		 1589 aa  146  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1589 aa  145  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  27 
 
 		 1559 aa  145  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1589 aa  145  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.39 
 
 		 1986 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23940  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1217 aa  142  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1722 aa  140  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1904 aa  140  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  26.16 
 
 		 1867 aa  139  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1572 aa  139  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  27.55 
 
 		 1980 aa  138  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  26.39 
 
 		 1754 aa  138  9e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  24.66 
 
 		 1973 aa  137  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  27.37 
 
 		 2045 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1823 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  27.55 
 
 		 1571 aa  135  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  24.76 
 
 		 2204 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  26.09 
 
 		 1950 aa  127  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  27.46 
 
 		 1991 aa  127  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1888 aa  126  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  28.27 
 
 		 2125 aa  121  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  28.27 
 
 		 2125 aa  121  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  25.77 
 
 		 1861 aa  121  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  25.31 
 
 		 1958 aa  121  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1801 aa  120  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  22.14 
 
 		 1403 aa  119  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  23.88 
 
 		 1853 aa  118  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  26.96 
 
 		 2123 aa  108  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.84 
 
 		 1363 aa  107  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  23.82 
 
 		 1296 aa  96.3  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  26.32 
 
 		 2005 aa  89.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  24.85 
 
 		 1328 aa  82  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1822 aa  75.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  26.71 
 
 		 2098 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  26.71 
 
 		 2098 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.53 
 
 		 1312 aa  64.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 		 2104 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  27.53 
 
 		 2098 aa  59.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 		 2101 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 		 2101 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  19.2 
 
 		 1367 aa  55.8  0.000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  22.85 
 
 		 1822 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  24.85 
 
 		 1629 aa  52  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  38.67 
 
 		 1838 aa  49.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1474 aa  47.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  24.84 
 
 		 1490 aa  47.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>