80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0830 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  100 
 
 
1506 aa  2875    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  49.64 
 
 
1412 aa  909    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  49.77 
 
 
1499 aa  1257    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  55.44 
 
 
1413 aa  1246    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  58.13 
 
 
1392 aa  1142    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  35.69 
 
 
1400 aa  559  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  35.2 
 
 
1407 aa  554  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1670  hypothetical protein  33.03 
 
 
1207 aa  550  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24380  hypothetical protein  36.08 
 
 
1670 aa  538  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694198  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0229  hypothetical protein  31.91 
 
 
1252 aa  520  1.0000000000000001e-145  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  32.94 
 
 
1254 aa  396  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3697  hypothetical protein  31.35 
 
 
1274 aa  308  7e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141497  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  29.61 
 
 
1877 aa  189  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  30.05 
 
 
1328 aa  179  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  25.93 
 
 
1854 aa  171  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  29.45 
 
 
1958 aa  171  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  28.2 
 
 
2096 aa  168  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  26.58 
 
 
2013 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23940  hypothetical protein  28.22 
 
 
1217 aa  165  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  23 
 
 
1622 aa  164  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  27.42 
 
 
1593 aa  161  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  28.83 
 
 
1572 aa  157  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  27.43 
 
 
1589 aa  155  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  27.05 
 
 
1589 aa  154  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.13 
 
 
1853 aa  151  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  29.79 
 
 
1559 aa  151  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  28.51 
 
 
1559 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  27.46 
 
 
1589 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  27.67 
 
 
1823 aa  150  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  29.27 
 
 
1803 aa  150  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  30.26 
 
 
2016 aa  148  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  27.43 
 
 
2222 aa  148  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  27.47 
 
 
2002 aa  147  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  26.35 
 
 
1973 aa  146  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  23.09 
 
 
1754 aa  146  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  29.05 
 
 
2207 aa  146  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.43 
 
 
1959 aa  145  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  29.89 
 
 
2198 aa  144  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  27.96 
 
 
2197 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  28.72 
 
 
1983 aa  142  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  28.48 
 
 
1945 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  24.56 
 
 
1722 aa  140  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  27.44 
 
 
1980 aa  139  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  26.41 
 
 
1571 aa  138  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  26.37 
 
 
1861 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  27.52 
 
 
1575 aa  138  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  28.89 
 
 
2204 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  27.07 
 
 
2045 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.98 
 
 
1986 aa  136  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.85 
 
 
1867 aa  135  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  23.53 
 
 
1888 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  26.95 
 
 
1991 aa  130  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  26.12 
 
 
1958 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  22.98 
 
 
2759 aa  124  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  25.97 
 
 
1801 aa  122  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  26.12 
 
 
1950 aa  121  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  24.96 
 
 
1904 aa  116  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  29.06 
 
 
2125 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  29.06 
 
 
2125 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  25.82 
 
 
2123 aa  106  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.42 
 
 
1363 aa  99.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  23.24 
 
 
1296 aa  91.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  28.67 
 
 
2005 aa  91.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  26.07 
 
 
1328 aa  86.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.58 
 
 
1403 aa  81.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  22.87 
 
 
1822 aa  80.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  25.97 
 
 
1838 aa  73.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  20.55 
 
 
1822 aa  72  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  20.84 
 
 
1367 aa  70.9  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  24.21 
 
 
2098 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  21.07 
 
 
1285 aa  67  0.000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.49 
 
 
1312 aa  67  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  24.21 
 
 
2101 aa  66.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  24.21 
 
 
2101 aa  66.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  25.63 
 
 
2098 aa  65.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  24.84 
 
 
2104 aa  65.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  25.63 
 
 
2098 aa  65.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  26.27 
 
 
1629 aa  59.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  20.8 
 
 
1121 aa  58.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1076  hypothetical protein  24.22 
 
 
194 aa  49.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000229233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>