| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | UUR10_0432 |
|---|
| Symbol | |
|---|
| ID | 6983814 |
|---|
| Type | CDS |
|---|
| Is gene spliced | No |
|---|
| Is pseudo gene | No |
|---|
| Organism name | Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 |
|---|
| Kingdom | Bacteria |
|---|
| Replicon accession | NC_011374 |
|---|
| Strand | + |
|---|
| Start bp | 479207 |
|---|
| End bp | 483064 |
|---|
| Gene Length | 3858 bp |
|---|
| Protein Length | 1285 aa |
|---|
| Translation table | 4 |
|---|
| GC content | 21% |
|---|
| IMG OID | 643400004 |
|---|
| Product | viral phosphatase |
|---|
| Protein accession | YP_002284825 |
|---|
| Protein GI | 209554174 |
|---|
| COG category | [L] Replication, recombination and repair |
|---|
| COG ID | [COG1112] Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits |
|---|
| TIGRFAM ID | |
|---|
| 
|
Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 7 |
|---|
| Plasmid unclonability p-value | 1 |
|---|
| Plasmid hitchhiking | No |
|---|
| Plasmid clonability | normal |
|---|
| |
Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | n/a |
|---|
| Fosmid unclonability p-value | n/a |
|---|
| Fosmid Hitchhiker | n/a |
|---|
| Fosmid clonability | n/a |
|---|
| |
Sequence |
| Gene sequence | ATGCAAGATG AACAATTGAA TAATAAAGCA ATTAAACAAA AAGTTTTAAA TTTACTATCA
ACTGATACAC GTGATAGTTG TATAAGAACA CGTTTAACAA AATATCATTT AGATATTACA
AACACTTTTA ATAAGCATGA ATTACAAGAT TTTATCGAAG GTAAAATTAA CGTTCTTAAA
ATTAAATCAT TTATTAATAC AAACATGTTT GAAAATAATC TTAAAAAAGC AGAATCAATG
GATGATGTAA TTGATTATTT ACAAGATTTT AACTTAAAAC TAAAAGATCT TTTATCCATG
CGTAAAATTA ATGAATGAAA TCAAGATTTT TTATTATATA AAAATGAACG AATTGCTGAT
ATGATCAAAG CAATTGAAAG CGAACCTAAA AAATTTGATC ATTTAAGCCG TGAAGCACGT
AGTATTTATG CTCAAACAGG AGTTTGACCT TTATTTATTG CTAAAAATTT TTTAATTGGT
CCAACCCCTA AACCCTCAAG TTTGAATGCT CCATTAATTT TTATTGATGT TGAAATCAAA
AAGCATAATG ATGAAATTTT TTTAAAACGT AAAAATACTA ATTTTATTGT TAATGAAAAA
CTATTATCTT TTTTAAAAAA TGATTTTAAA AATAATATTG TTTCATTAAA TGAAATTAAA
AATTTTAATT ATTTAGATAT CCAAAATTTA ATTAAAAAAA TCACTTTAAA AGAGCATTTA
GAATCAATTG TTGATAATAA TGGTTTTTTA AATTTAAAAC AAAATGAAAT TAAAGAACAA
TTTAATAATT TATTTTTATA TGACGCTTAT GTTTTAGGTA TTTTTGAACC ACTTGGTGGA
GCTATTAAAA ATGATTTAGA AACTATTATT AATAGTAATA TTGATCCATT TGATGAAGAA
ATTAATAATA CTAACCAACA AATTTATAAT AAAAATTATC ATCATTTAGC TGAAGAAAAT
AAACTTCCAT TAATCCAAAT TAACCGACCA TTAAATATTT TTCAAAAATA TGCTATTCAT
TCAGCATTAG TTAAAAATAC TTTAATATAT GGACCGCCTG GAACAGGTAA ATCAGAGGTT
ATTGCAAGTA TTATTGCTAA TGTGATTAAT GATTTAAAAA CAACTTTAAT TATTTCAGAA
AAAAAAGCTG CATTAGATGT ATTACATGAA AGATTAACTA AAATTAGTTT TTTTGCACTT
TTTATTTATG ATACAAACAA TGATGATCAA TTCTATAATA ATATTTTTAA TTTAATTGAA
AAAATCGGTG GATTAAGATT TATTGATAGT CAAAACTCAA ACCAAGTTCA TGATTTTAAA
TACAAAAACA ATATTATTTC AAATATTTTT TATAAAAAGA TTCATGAATT AAAAAAAGAA
ATTATTAATA TTTCATCACT AATTAAAAAT TTACATAATG AAAAAGATAC TAACAATAAT
AATTTTGCTA ATTATTTATA TTGACTATCA CGATTTAATG AATCTGAAAT TAAATTTATT
AATGATGAAA ATTTAATTAA TCAAATCAAA AACTTAATTA AAACTTATTC ATACACTTTT
GATGAAATTA TTGCACACGC TAAAAATAGT CATTACTTTT TTAAAAAGTA TAATTACGAA
TTTTCTAAAA ATAATTTATT AAAATTCAAA GAAGAAAATA ACCAATTAAA CCAGTTACAA
ATTGATTTTA ATTTAATTAC GAAATCTTTA TATCAAAGCC AAACTTTTTT AGCACGAATT
AATTTATTAG AAAGTTTTTT AGTTAAAAAT AACATGATTT TAACCAGTTT TATATATGAA
GATGCAAATC TATTAAGTAA TGCTTATGTT GAAACCAATG AATTTTATGT AAAATTTAAC
TATCTTTTAA AAGATGATTT CAAAAAATTT CTTGAAGAGA ATACAAAAAC ACATTCAACA
TTTTTAAATA ATTTAAATAA TTTAAAAAAT ACTGATTGAC CTTATGTTTT TGAACAATAT
TTATTAACTA ATAATCCTTT AGCAAAAAAG GGTATGTTCA AAAAAATTAA GGGTGATGAA
AAAACTTTAT TAAAACAATT AGAAGTGCTT AAAGCATATT TTAATAATCC AATTTTATCA
AAATTCAATT TTTTATTTTT AGAAGATTTA ATGAACCAAC CAATTGAAAT TTTTAATATT
GAAAATATTG TTTATTTGAA TAATAAACAG TTGTTAACTA AACCTTATGC TAAAGATTTG
TATGAAAATG TTTTTGATAA AAATTTATCG TATGAATTAA TTTTGCAACT TAAAGATTTA
AATTTAAATA GTGAACAATA TGACATTATC AATGATTTAA TTCAATACCA AAATGAAGTT
TTAATTAATT ACGAATTTAT TAAAAATACT GATTTTTTTA ACTTATGTAA AAAACTAAGA
GATGCTAATA TCCAATTTTC TAAAAATGCT GATGAAATTA TTTACAATAA TTATTTAGAT
TATTTACAAA TCAAATTAAT CACTGCACCA AAACAAATGC AAACCAAAAT TAAAGAAATT
GCGCAAATTT GTCGTTTAAC AAAAAAACCT AATATTGTTA AATTTATTTT AAAGTATTAT
GAAGTTTTGC GCTTCCTTTT TCCAATTTGG ATTAGTAAAC CAGAACTTGT TAGTGAAATG
TTGCCATTAA TAAACAAAAG CTTTGATTAT GGAATTTTTG ATGAAGCTTC ACAGATGTTT
TTAGAACGTT CATATCCATC AATTTATCGT TGCAATATTA ATATTGTGGC AGGGGATGAT
AAACAATTAT GTCCTACTAA TTTTTTCATT AATCGTCAAG ATAGCGAAAG TGATGAATTT
GAATTAGCTG ATGTAGATGT TGCAGAAAGT TTGTTAGATC GTGCTAAAAC CGCTTTATGA
TCAGAGTATT TACTAAAAAA TCATTATCGT TCTAATCGTG ATGATTTAAT TAGTTTTAGT
AATGAAAATA TTTATAACAA TGAATTACAT TTTGCATCTA AAAATGGATT ATTTGAACCA
GGAATTGAAG TTATTAATGT TAATGGTACA TTTGAGAATG ATAATAGCAT TGAAGCACAA
AAAATTGTAG AAATTCTAAA AGAACAAGCT GCTAATTATA AAAAAATTAT TGTGATTACT
TTTAATATTA AACAAAGTGA ATTAATTGAA AATTTAATAT TACAAACTTT TAGTTTTAAT
GATGTGATTT ATCAACGTTT TGAAAATGAT GAAATCATTG TTACCAATTT AGAAAATGTT
CAAGGTAATG AAGCTGATTT AGTAATCCTA TCAGTTACTT ACGCAAAAAA CAAAGAAGGA
ATTTTACGTA ACAATTATGG ACCATTAATG AAAAAGGGTG GCGCTAATCG TTTAAACGTA
GCGATCACAA GAGCAGCAGA TAAAATGATA GTTGTTAAAT CAATTAAAGC AGTTGATATG
ATGGTTAATA TTAATAATGA TAACATTCGG ACTTTTAAAA ATTTTATTGC TTATTGTGAT
GAAATTACAC AATTAGCTAA CCAAAATAAA TTTCAAAATT ATCTATCTTT TAATGAAGAA
TTTTTAACAA GTTTTGAAAA AATTATCTTA ACAATTTTAA AAGATCACAA AAAAGCTAAC
CAACAAATTT TACATAAATT AAAAATTGGT AATTTTAATA TTGCTTTTGC TTTATATAAT
TTAGATAATC AAAAAATTGA TTTACTTGTG TGTTTAGAAG AATTTAATGA GTGAAAATCT
TATAATCTTT TAGAAATTTA TGATCAATTT AATTTTTTAA TGGATCGTGG TTATAAAACA
ATTATTATTA ATGATTATGA AATTTGTTTA AATTATCATC AAGTTAAAAA TAATATTATT
AAATTGATAC AATTATAA
|
|---|
| Protein sequence | MQDEQLNNKA IKQKVLNLLS TDTRDSCIRT RLTKYHLDIT NTFNKHELQD FIEGKINVLK
IKSFINTNMF ENNLKKAESM DDVIDYLQDF NLKLKDLLSM RKINEWNQDF LLYKNERIAD
MIKAIESEPK KFDHLSREAR SIYAQTGVWP LFIAKNFLIG PTPKPSSLNA PLIFIDVEIK
KHNDEIFLKR KNTNFIVNEK LLSFLKNDFK NNIVSLNEIK NFNYLDIQNL IKKITLKEHL
ESIVDNNGFL NLKQNEIKEQ FNNLFLYDAY VLGIFEPLGG AIKNDLETII NSNIDPFDEE
INNTNQQIYN KNYHHLAEEN KLPLIQINRP LNIFQKYAIH SALVKNTLIY GPPGTGKSEV
IASIIANVIN DLKTTLIISE KKAALDVLHE RLTKISFFAL FIYDTNNDDQ FYNNIFNLIE
KIGGLRFIDS QNSNQVHDFK YKNNIISNIF YKKIHELKKE IINISSLIKN LHNEKDTNNN
NFANYLYWLS RFNESEIKFI NDENLINQIK NLIKTYSYTF DEIIAHAKNS HYFFKKYNYE
FSKNNLLKFK EENNQLNQLQ IDFNLITKSL YQSQTFLARI NLLESFLVKN NMILTSFIYE
DANLLSNAYV ETNEFYVKFN YLLKDDFKKF LEENTKTHST FLNNLNNLKN TDWPYVFEQY
LLTNNPLAKK GMFKKIKGDE KTLLKQLEVL KAYFNNPILS KFNFLFLEDL MNQPIEIFNI
ENIVYLNNKQ LLTKPYAKDL YENVFDKNLS YELILQLKDL NLNSEQYDII NDLIQYQNEV
LINYEFIKNT DFFNLCKKLR DANIQFSKNA DEIIYNNYLD YLQIKLITAP KQMQTKIKEI
AQICRLTKKP NIVKFILKYY EVLRFLFPIW ISKPELVSEM LPLINKSFDY GIFDEASQMF
LERSYPSIYR CNINIVAGDD KQLCPTNFFI NRQDSESDEF ELADVDVAES LLDRAKTALW
SEYLLKNHYR SNRDDLISFS NENIYNNELH FASKNGLFEP GIEVINVNGT FENDNSIEAQ
KIVEILKEQA ANYKKIIVIT FNIKQSELIE NLILQTFSFN DVIYQRFEND EIIVTNLENV
QGNEADLVIL SVTYAKNKEG ILRNNYGPLM KKGGANRLNV AITRAADKMI VVKSIKAVDM
MVNINNDNIR TFKNFIAYCD EITQLANQNK FQNYLSFNEE FLTSFEKIIL TILKDHKKAN
QQILHKLKIG NFNIAFALYN LDNQKIDLLV CLEEFNEWKS YNLLEIYDQF NFLMDRGYKT
IIINDYEICL NYHQVKNNII KLIQL
|
|---|
| |