160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0996 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  100 
 
 		 1312 aa  2705    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.39 
 
 		 1403 aa  233  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  33.8 
 
 		 2098 aa  218  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  34.15 
 
 		 2098 aa  214  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  33.17 
 
 		 2104 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  33.42 
 
 		 2101 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  33.42 
 
 		 2101 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  33.42 
 
 		 2098 aa  202  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  35.71 
 
 		 1296 aa  196  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  32.29 
 
 		 2005 aa  189  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  35.43 
 
 		 1363 aa  189  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1904 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  35.47 
 
 		 2013 aa  184  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1888 aa  183  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1823 aa  183  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  29.03 
 
 		 2123 aa  181  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  29.51 
 
 		 2759 aa  181  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  33.08 
 
 		 1822 aa  181  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  29.96 
 
 		 1973 aa  180  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  33.85 
 
 		 1328 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  27.7 
 
 		 1991 aa  180  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  26.74 
 
 		 1867 aa  178  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  30.42 
 
 		 2016 aa  177  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  31.95 
 
 		 1838 aa  177  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1822 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  32.7 
 
 		 2125 aa  177  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  32.7 
 
 		 2125 aa  177  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  29.18 
 
 		 2198 aa  177  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.27 
 
 		 1877 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  28.6 
 
 		 1861 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  30.69 
 
 		 1622 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  29.75 
 
 		 1593 aa  176  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  33.13 
 
 		 1945 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1328 aa  175  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  31.02 
 
 		 2207 aa  174  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  32 
 
 		 1803 aa  174  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  30.41 
 
 		 1959 aa  173  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  28.75 
 
 		 1958 aa  172  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  26.81 
 
 		 2045 aa  172  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.72 
 
 		 1853 aa  170  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  32.09 
 
 		 2222 aa  168  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1854 aa  168  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1572 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  30.13 
 
 		 2197 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1575 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1722 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  29.54 
 
 		 1980 aa  165  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  27.59 
 
 		 2204 aa  164  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  28.23 
 
 		 2002 aa  163  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  30.95 
 
 		 2096 aa  163  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1801 aa  161  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  28.75 
 
 		 1950 aa  160  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  28.6 
 
 		 1986 aa  160  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  30.09 
 
 		 1754 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  28.66 
 
 		 1958 aa  157  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  30.49 
 
 		 1559 aa  155  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  26.87 
 
 		 1983 aa  155  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1589 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1589 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  27.61 
 
 		 1589 aa  152  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  31.37 
 
 		 1571 aa  151  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  25.42 
 
 		 1559 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  28.31 
 
 		 1367 aa  138  7.000000000000001e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  34.6 
 
 		 1285 aa  138  8e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  32.57 
 
 		 1050 aa  129  3e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  26.96 
 
 		 905 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  28.16 
 
 		 905 aa  101  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  28.83 
 
 		 905 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  26.35 
 
 		 907 aa  97.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  28.61 
 
 		 905 aa  98.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  28.61 
 
 		 905 aa  97.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  30.38 
 
 		 903 aa  95.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  26.5 
 
 		 900 aa  94.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  28.71 
 
 		 908 aa  94  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  28.27 
 
 		 906 aa  90.9  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  25.36 
 
 		 1622 aa  83.2  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  21.89 
 
 		 1489 aa  82.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  23.05 
 
 		 1629 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  23.49 
 
 		 1575 aa  80.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1652 aa  76.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  25.32 
 
 		 1557 aa  74.3  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  21.71 
 
 		 1490 aa  73.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  26.54 
 
 		 1121 aa  72  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1400 aa  72  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1407 aa  68.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  23.98 
 
 		 1649 aa  68.6  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  26.28 
 
 		 925 aa  67.8  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  22.48 
 
 		 1790 aa  67  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1506 aa  67  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.17 
 
 		 636 aa  67.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  23.68 
 
 		 636 aa  65.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  21.8 
 
 		 1630 aa  65.5  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  20.94 
 
 		 932 aa  65.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1413 aa  64.3  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  22.59 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  22.44 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  24.59 
 
 		 914 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1392 aa  62  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.01 
 
 		 1203 aa  62  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1474 aa  61.6  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>