More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28895 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  64 
 
 		 2101 aa  2605    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  64.09 
 
 		 2098 aa  2610    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  63.86 
 
 		 2104 aa  2635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  100 
 
 		 2098 aa  4179    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  64 
 
 		 2101 aa  2605    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  98.71 
 
 		 2098 aa  4125    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.77 
 
 		 1403 aa  302  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  33.72 
 
 		 1822 aa  228  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  32.26 
 
 		 1838 aa  221  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  34.35 
 
 		 2002 aa  221  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  29.5 
 
 		 1822 aa  216  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  33.27 
 
 		 1983 aa  214  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  32.62 
 
 		 1986 aa  214  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  32.62 
 
 		 1622 aa  212  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  29.61 
 
 		 2207 aa  212  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1801 aa  213  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  34.97 
 
 		 1296 aa  210  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  32.45 
 
 		 1973 aa  209  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  31.83 
 
 		 1803 aa  207  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  30.78 
 
 		 2013 aa  208  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  31.42 
 
 		 2759 aa  207  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  31.88 
 
 		 1950 aa  207  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  32.06 
 
 		 1958 aa  206  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  30.1 
 
 		 1958 aa  204  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  30.75 
 
 		 1959 aa  204  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  31.7 
 
 		 1328 aa  202  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  31.64 
 
 		 1722 aa  202  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  32.73 
 
 		 1867 aa  202  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  31.53 
 
 		 2197 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.15 
 
 		 1312 aa  199  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  30.8 
 
 		 2016 aa  200  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  30.2 
 
 		 2204 aa  199  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  30.52 
 
 		 2198 aa  199  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  32.83 
 
 		 2125 aa  198  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  32.83 
 
 		 2125 aa  198  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  30.9 
 
 		 1991 aa  198  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  31.47 
 
 		 1754 aa  197  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  33.66 
 
 		 1575 aa  196  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  31.5 
 
 		 1328 aa  195  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  30.72 
 
 		 1945 aa  192  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  31.35 
 
 		 1823 aa  191  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  31.42 
 
 		 2096 aa  190  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  33.84 
 
 		 1363 aa  191  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  38.92 
 
 		 2005 aa  189  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1888 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  32.02 
 
 		 1589 aa  187  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1589 aa  186  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  31.7 
 
 		 1877 aa  186  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  31.75 
 
 		 1854 aa  186  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  30.89 
 
 		 1559 aa  186  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  32.15 
 
 		 1589 aa  186  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  32.95 
 
 		 1367 aa  185  7e-45  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  31.98 
 
 		 2222 aa  184  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  29.92 
 
 		 2045 aa  181  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  31.87 
 
 		 1980 aa  180  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  35.14 
 
 		 1285 aa  179  4e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  30.83 
 
 		 1853 aa  179  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1904 aa  178  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  32.2 
 
 		 1571 aa  178  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  31 
 
 		 1593 aa  177  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1572 aa  173  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  32.03 
 
 		 1559 aa  172  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  31.74 
 
 		 2123 aa  170  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  31.02 
 
 		 1861 aa  161  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2697  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 		 691 aa  139  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1113  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 		 817 aa  137  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1503  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.78 
 
 		 862 aa  125  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  30.67 
 
 		 1622 aa  109  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  26.75 
 
 		 1050 aa  103  3e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  31.71 
 
 		 903 aa  103  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  25 
 
 		 1121 aa  102  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  30.46 
 
 		 1630 aa  101  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  25.49 
 
 		 1790 aa  92.8  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  25.19 
 
 		 1387 aa  92.4  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  30.65 
 
 		 946 aa  92  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1652 aa  92  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  28.27 
 
 		 1557 aa  89.7  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  26.42 
 
 		 1410 aa  89  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  30.38 
 
 		 908 aa  89  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  28.99 
 
 		 907 aa  87  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  24.89 
 
 		 1697 aa  86.7  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  26.04 
 
 		 1489 aa  85.9  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  26.65 
 
 		 905 aa  84  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  29.08 
 
 		 633 aa  84  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  29.89 
 
 		 1649 aa  83.6  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  27.27 
 
 		 905 aa  83.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  27.69 
 
 		 900 aa  82.8  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  25.35 
 
 		 905 aa  81.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  29.08 
 
 		 633 aa  80.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  25.54 
 
 		 1694 aa  80.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  25.91 
 
 		 1629 aa  80.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  25.17 
 
 		 905 aa  81.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  25.81 
 
 		 906 aa  80.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.08 
 
 		 1044 aa  80.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  27.69 
 
 		 905 aa  80.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1392 aa  79.7  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1474 aa  79.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  26.34 
 
 		 1575 aa  79.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0870  serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 903 aa  76.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87865  normal  0.209355 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  28.1 
 
 		 633 aa  76.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>