193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1883 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  100 
 
 
1284 aa  2579    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  36.83 
 
 
1284 aa  262  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  33.25 
 
 
1653 aa  207  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  28.57 
 
 
585 aa  139  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  32.72 
 
 
1585 aa  134  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  32.72 
 
 
1585 aa  134  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  27.9 
 
 
1620 aa  127  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  31.71 
 
 
1099 aa  126  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  30.23 
 
 
643 aa  118  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  28.68 
 
 
754 aa  117  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  23.43 
 
 
941 aa  112  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  28.44 
 
 
611 aa  109  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  29.18 
 
 
1126 aa  107  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  30.23 
 
 
633 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  29.87 
 
 
650 aa  103  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  25.3 
 
 
1018 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  28.65 
 
 
633 aa  102  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  27.61 
 
 
1048 aa  100  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  29.77 
 
 
650 aa  100  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  28.29 
 
 
636 aa  99.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  29.38 
 
 
633 aa  99.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  26.97 
 
 
609 aa  96.7  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  25 
 
 
715 aa  95.9  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  24.93 
 
 
619 aa  95.1  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  29.02 
 
 
633 aa  95.1  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  28.17 
 
 
716 aa  94.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  26.71 
 
 
655 aa  93.2  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  22.92 
 
 
952 aa  92.8  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  25 
 
 
622 aa  92.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  26.97 
 
 
651 aa  92.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  24.63 
 
 
622 aa  92.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.36 
 
 
752 aa  92.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  26.36 
 
 
1190 aa  91.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  24.86 
 
 
1175 aa  91.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  24.19 
 
 
986 aa  90.9  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  28.3 
 
 
1111 aa  90.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  25 
 
 
479 aa  90.5  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  24.64 
 
 
934 aa  89.4  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  25.07 
 
 
466 aa  88.6  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  24.26 
 
 
632 aa  87.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  26.07 
 
 
797 aa  87.8  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  28.4 
 
 
1651 aa  87  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  29.1 
 
 
2245 aa  86.7  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  23.67 
 
 
636 aa  86.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  26.99 
 
 
1108 aa  86.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  23.85 
 
 
902 aa  85.9  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  23.48 
 
 
902 aa  85.9  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  24.2 
 
 
606 aa  86.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25.9 
 
 
1999 aa  84.3  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  26.49 
 
 
1212 aa  83.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  26.04 
 
 
901 aa  82  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  25.77 
 
 
748 aa  81.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.45 
 
 
254 aa  81.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.92 
 
 
1097 aa  80.5  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  25.89 
 
 
388 aa  80.5  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.85 
 
 
1428 aa  79.7  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  23.05 
 
 
1408 aa  80.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.42 
 
 
635 aa  79.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  29.05 
 
 
686 aa  79  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  25.86 
 
 
1077 aa  78.6  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  24.75 
 
 
1041 aa  76.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  25.44 
 
 
629 aa  75.5  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  40.68 
 
 
464 aa  74.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  24.08 
 
 
1137 aa  73.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  23.25 
 
 
1038 aa  71.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2944  serine/threonine kinase protein  32 
 
 
762 aa  69.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  27.03 
 
 
283 aa  68.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  22.45 
 
 
1427 aa  67.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  23.68 
 
 
759 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  24.3 
 
 
1090 aa  66.6  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  24.29 
 
 
553 aa  66.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  24.29 
 
 
553 aa  66.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.76 
 
 
1203 aa  66.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  24.63 
 
 
759 aa  66.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  24.08 
 
 
759 aa  66.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  26.18 
 
 
315 aa  65.5  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  24.48 
 
 
769 aa  65.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  23.82 
 
 
759 aa  65.1  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  23.82 
 
 
759 aa  65.1  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  23.36 
 
 
932 aa  65.1  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  23.16 
 
 
759 aa  65.1  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  23.82 
 
 
759 aa  65.1  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  23.88 
 
 
769 aa  65.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  24.76 
 
 
486 aa  64.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  23.88 
 
 
759 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  23.82 
 
 
759 aa  63.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  24.7 
 
 
795 aa  63.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  21.93 
 
 
925 aa  61.6  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  25.9 
 
 
1189 aa  61.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  23.48 
 
 
944 aa  60.1  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.91 
 
 
1196 aa  59.7  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  23.05 
 
 
1062 aa  60.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.14 
 
 
1126 aa  59.3  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  24.37 
 
 
1116 aa  58.9  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  22.08 
 
 
922 aa  57.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  28.88 
 
 
1121 aa  57.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  22.54 
 
 
1557 aa  57.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  19.76 
 
 
1056 aa  57.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  22.55 
 
 
916 aa  57.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  24.04 
 
 
521 aa  57  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>