244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0940 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  58.81 
 
 		 643 aa  716    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  100 
 
 		 650 aa  1299    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  98.92 
 
 		 650 aa  1286    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  45.31 
 
 		 655 aa  547  1e-154  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  47.66 
 
 		 754 aa  539  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  43.79 
 
 		 633 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  44.1 
 
 		 633 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  43.08 
 
 		 633 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  41.55 
 
 		 633 aa  457  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  35.49 
 
 		 619 aa  316  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  35.91 
 
 		 622 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  35.75 
 
 		 622 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  36.6 
 
 		 609 aa  301  3e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  33.58 
 
 		 651 aa  286  7e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  33.61 
 
 		 632 aa  279  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  32.4 
 
 		 636 aa  279  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  31.09 
 
 		 635 aa  277  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  31.37 
 
 		 636 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  34.07 
 
 		 716 aa  269  8.999999999999999e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  32.25 
 
 		 748 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  32.61 
 
 		 611 aa  258  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  36.14 
 
 		 686 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  34.42 
 
 		 466 aa  226  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  33.95 
 
 		 464 aa  219  8.999999999999998e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  35.12 
 
 		 952 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  32.69 
 
 		 1999 aa  212  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  40.69 
 
 		 934 aa  196  8.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  31 
 
 		 797 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  40.13 
 
 		 388 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  39 
 
 		 902 aa  189  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  33 
 
 		 1077 aa  184  6e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  32.53 
 
 		 1090 aa  182  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  37.42 
 
 		 479 aa  182  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  37.78 
 
 		 901 aa  181  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  36.18 
 
 		 986 aa  178  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  37.2 
 
 		 902 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  36.81 
 
 		 1097 aa  172  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  29.58 
 
 		 2245 aa  171  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.65 
 
 		 629 aa  168  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  28.94 
 
 		 1099 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  31.05 
 
 		 1048 aa  163  9e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  30.74 
 
 		 553 aa  157  7e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  30.74 
 
 		 553 aa  157  7e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  38.33 
 
 		 268 aa  154  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  37.15 
 
 		 752 aa  151  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  31.62 
 
 		 941 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  30.66 
 
 		 486 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  32.38 
 
 		 606 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  39.35 
 
 		 237 aa  138  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  28.54 
 
 		 585 aa  138  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  26.97 
 
 		 795 aa  136  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  28.16 
 
 		 715 aa  134  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1018 aa  131  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  32.05 
 
 		 1189 aa  126  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  33.2 
 
 		 283 aa  122  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  23.26 
 
 		 1585 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  23.26 
 
 		 1585 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  29.3 
 
 		 1653 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  31.58 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  23.99 
 
 		 1620 aa  115  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  29.72 
 
 		 521 aa  110  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  24.68 
 
 		 1190 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  24.81 
 
 		 1108 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  28.34 
 
 		 297 aa  103  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  29.77 
 
 		 1284 aa  100  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 2310 aa  99.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  26.85 
 
 		 759 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  29.17 
 
 		 1038 aa  98.6  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  26.64 
 
 		 759 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  26.74 
 
 		 759 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  26.79 
 
 		 759 aa  97.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  26.79 
 
 		 759 aa  97.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  26.74 
 
 		 759 aa  97.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  26.74 
 
 		 769 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  26.85 
 
 		 759 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  26.47 
 
 		 769 aa  95.5  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  26.32 
 
 		 759 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.21 
 
 		 1428 aa  94  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  26.43 
 
 		 759 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  24.63 
 
 		 1126 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  26.19 
 
 		 1111 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1116 aa  92  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1126 aa  92  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.47 
 
 		 1196 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  27.13 
 
 		 1082 aa  89  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  27.37 
 
 		 928 aa  88.6  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  25.27 
 
 		 1284 aa  85.5  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.24 
 
 		 932 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  27.27 
 
 		 916 aa  85.1  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  22.65 
 
 		 1427 aa  84.7  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  26.22 
 
 		 922 aa  84  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  22.93 
 
 		 1175 aa  84  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  26.5 
 
 		 1041 aa  82  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  26.52 
 
 		 1651 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  24.71 
 
 		 1261 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1275 aa  81.3  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  28.98 
 
 		 1271 aa  80.9  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  27.13 
 
 		 659 aa  80.9  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  29.17 
 
 		 1270 aa  79.7  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1118 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>