152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1516 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  44.07 
 
 		 1275 aa  1095    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  37.7 
 
 		 1255 aa  736    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  48.12 
 
 		 1259 aa  1075    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  100 
 
 		 1271 aa  2600    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  31.33 
 
 		 1457 aa  171  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  29.37 
 
 		 1261 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  30.06 
 
 		 1427 aa  162  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  29.54 
 
 		 1403 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  28.57 
 
 		 1408 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  28.86 
 
 		 606 aa  136  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  28.16 
 
 		 486 aa  125  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1215 aa  121  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.11 
 
 		 1428 aa  118  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  29.76 
 
 		 1270 aa  118  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  28.64 
 
 		 1228 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  29 
 
 		 1097 aa  113  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1118 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1247 aa  108  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  29.65 
 
 		 1196 aa  108  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1126 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  29.07 
 
 		 1151 aa  107  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1215 aa  107  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  30.85 
 
 		 1250 aa  104  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.24 
 
 		 1324 aa  104  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1116 aa  102  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  27.13 
 
 		 1143 aa  102  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  27.13 
 
 		 1143 aa  102  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1139 aa  101  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  29.53 
 
 		 934 aa  100  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  27.61 
 
 		 902 aa  99.4  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  27.13 
 
 		 1143 aa  98.6  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  29.44 
 
 		 1163 aa  98.2  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  28.26 
 
 		 986 aa  98.2  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1350 aa  95.5  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  28.4 
 
 		 622 aa  94.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  29.25 
 
 		 651 aa  93.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  27.98 
 
 		 622 aa  93.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  28.64 
 
 		 901 aa  93.2  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.49 
 
 		 1048 aa  90.9  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  27.52 
 
 		 902 aa  89.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  27.06 
 
 		 1198 aa  88.6  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  26.89 
 
 		 1082 aa  87.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  27.78 
 
 		 619 aa  86.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1121 aa  86.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1172 aa  84  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  27.8 
 
 		 643 aa  83.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  25.25 
 
 		 1153 aa  82  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  28.98 
 
 		 650 aa  82  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  28.72 
 
 		 629 aa  80.9  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  28.98 
 
 		 650 aa  80.9  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  25.85 
 
 		 655 aa  80.5  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  27.02 
 
 		 1280 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.68 
 
 		 752 aa  80.1  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  26.19 
 
 		 716 aa  80.1  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  26.68 
 
 		 1111 aa  79.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  26.69 
 
 		 609 aa  77.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  26.04 
 
 		 632 aa  76.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  23.89 
 
 		 635 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  26.69 
 
 		 636 aa  74.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  22.36 
 
 		 633 aa  73.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  23.83 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  26.39 
 
 		 611 aa  69.7  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  26.3 
 
 		 754 aa  68.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  24.9 
 
 		 466 aa  67.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  24.91 
 
 		 633 aa  65.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  23.3 
 
 		 686 aa  63.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  21.4 
 
 		 1137 aa  63.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  24.28 
 
 		 1090 aa  63.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  26.73 
 
 		 1980 aa  62.4  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  23.55 
 
 		 633 aa  62.4  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  24.57 
 
 		 633 aa  62  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  26.9 
 
 		 1651 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  25.18 
 
 		 795 aa  60.1  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  23.04 
 
 		 797 aa  60.1  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  25.17 
 
 		 1077 aa  60.1  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  25.48 
 
 		 1620 aa  59.7  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  28.18 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  28.18 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  26.18 
 
 		 1559 aa  58.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  28.15 
 
 		 1038 aa  58.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  27.53 
 
 		 748 aa  57  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  38.71 
 
 		 1041 aa  57.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  23.99 
 
 		 659 aa  57.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  25.21 
 
 		 530 aa  56.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  25.16 
 
 		 1585 aa  56.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  24.39 
 
 		 1585 aa  56.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  26.32 
 
 		 1189 aa  55.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1572 aa  55.8  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  25.28 
 
 		 388 aa  55.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  27.15 
 
 		 769 aa  55.5  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  24.12 
 
 		 283 aa  54.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  26.46 
 
 		 759 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1175 aa  54.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1888 aa  53.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  24.75 
 
 		 916 aa  53.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  23.37 
 
 		 479 aa  53.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0994  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  50 
 
 		 634 aa  53.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0120944  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  26.37 
 
 		 769 aa  53.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  25.43 
 
 		 585 aa  52.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25.37 
 
 		 1999 aa  53.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>