128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29532 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  100 
 
 		 237 aa  486  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  44.03 
 
 		 609 aa  174  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  40.08 
 
 		 748 aa  164  8e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  42.34 
 
 		 464 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  39.48 
 
 		 754 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  40.17 
 
 		 622 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  39.75 
 
 		 619 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  39.35 
 
 		 650 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  37.44 
 
 		 716 aa  137  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  34.48 
 
 		 655 aa  137  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  39.35 
 
 		 650 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  38.66 
 
 		 622 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  40.39 
 
 		 686 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  37.34 
 
 		 651 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  32.89 
 
 		 632 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  33.19 
 
 		 611 aa  121  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  33.96 
 
 		 643 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  32.6 
 
 		 635 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  32.41 
 
 		 797 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  32.02 
 
 		 636 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  32.6 
 
 		 636 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  33.18 
 
 		 1090 aa  106  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  34.59 
 
 		 633 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  32.09 
 
 		 633 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  34.93 
 
 		 466 aa  102  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  32.7 
 
 		 1077 aa  102  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  34.05 
 
 		 633 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  33.19 
 
 		 1097 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  32.97 
 
 		 633 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.66 
 
 		 629 aa  98.2  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  31.98 
 
 		 952 aa  97.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  34.56 
 
 		 1189 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  35.96 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  33.48 
 
 		 752 aa  89  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  33.66 
 
 		 902 aa  88.6  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  31.31 
 
 		 795 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  29.33 
 
 		 479 aa  87.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  32.6 
 
 		 901 aa  87  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  31.86 
 
 		 934 aa  86.3  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  30.81 
 
 		 1999 aa  85.1  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  29.65 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  33.85 
 
 		 553 aa  84  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  33.85 
 
 		 553 aa  84  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  29.33 
 
 		 902 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  32.62 
 
 		 941 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  30.54 
 
 		 986 aa  78.6  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  27.59 
 
 		 1048 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  30.84 
 
 		 2245 aa  75.1  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  29.68 
 
 		 606 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1118 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  29.9 
 
 		 283 aa  72  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1116 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  29.58 
 
 		 1175 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1126 aa  69.3  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  31.02 
 
 		 1082 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  26.79 
 
 		 1212 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  27.08 
 
 		 715 aa  65.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1018 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1172 aa  65.5  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  28.05 
 
 		 1585 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  28.05 
 
 		 1585 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.71 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  27.78 
 
 		 1653 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  28.43 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  30.46 
 
 		 1270 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  27.54 
 
 		 1190 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  29.47 
 
 		 1143 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  28.29 
 
 		 1143 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  28.29 
 
 		 1143 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  25 
 
 		 486 aa  58.9  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  26.87 
 
 		 1038 aa  58.9  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  28.51 
 
 		 1041 aa  58.5  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  26.07 
 
 		 1137 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1139 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  28.47 
 
 		 2310 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  26.27 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  32.09 
 
 		 1151 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  34.44 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  30 
 
 		 1215 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  36.54 
 
 		 1350 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1247 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  45.35 
 
 		 1163 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  32.81 
 
 		 1280 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  29.6 
 
 		 769 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  32.54 
 
 		 1121 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  33.33 
 
 		 944 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  30.05 
 
 		 1620 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  26.02 
 
 		 1126 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  29.81 
 
 		 928 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1215 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  31.71 
 
 		 914 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  30.81 
 
 		 1198 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  28 
 
 		 1408 aa  52  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  31.71 
 
 		 1651 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  28.85 
 
 		 1228 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.74 
 
 		 922 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  31.2 
 
 		 1196 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  29.2 
 
 		 958 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.77 
 
 		 1324 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  32.56 
 
 		 1427 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>