221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1489 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  100 
 
 		 1018 aa  2026    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  48.47 
 
 		 941 aa  744    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  30.65 
 
 		 1099 aa  136  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  33.33 
 
 		 479 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  29.28 
 
 		 754 aa  132  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  30.61 
 
 		 650 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  30.61 
 
 		 650 aa  131  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  27.89 
 
 		 643 aa  131  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  31.8 
 
 		 636 aa  131  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  31.12 
 
 		 1077 aa  128  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  31.25 
 
 		 611 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  31.02 
 
 		 632 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  30.29 
 
 		 748 aa  121  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  30.5 
 
 		 466 aa  121  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  28.22 
 
 		 655 aa  118  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  27.09 
 
 		 633 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  26.05 
 
 		 633 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  26.48 
 
 		 633 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  29.43 
 
 		 635 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  31.42 
 
 		 464 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  35.08 
 
 		 619 aa  115  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  29.82 
 
 		 797 aa  115  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  34.75 
 
 		 622 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  34.1 
 
 		 622 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  29.86 
 
 		 1620 aa  111  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  34.64 
 
 		 986 aa  110  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  29.26 
 
 		 952 aa  110  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  28.62 
 
 		 633 aa  109  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  34.11 
 
 		 651 aa  110  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  29.28 
 
 		 1585 aa  109  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  29.28 
 
 		 1585 aa  109  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  29.2 
 
 		 636 aa  107  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  29.43 
 
 		 1090 aa  107  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  31.29 
 
 		 585 aa  106  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  30.18 
 
 		 1651 aa  104  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  28.95 
 
 		 553 aa  104  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  28.95 
 
 		 553 aa  104  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  25.3 
 
 		 1284 aa  104  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.26 
 
 		 1048 aa  102  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  30.46 
 
 		 268 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  28.12 
 
 		 388 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  31.27 
 
 		 609 aa  101  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  29.39 
 
 		 486 aa  100  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  33.97 
 
 		 902 aa  99.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.47 
 
 		 752 aa  99  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  29.65 
 
 		 1126 aa  95.9  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  26.06 
 
 		 1653 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  30.31 
 
 		 934 aa  95.1  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  32.36 
 
 		 902 aa  94.7  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  30 
 
 		 1189 aa  93.6  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  26.77 
 
 		 1999 aa  93.6  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  25.44 
 
 		 759 aa  92.8  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  28.75 
 
 		 629 aa  92.8  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  25.44 
 
 		 759 aa  92.4  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  25.44 
 
 		 759 aa  92  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  28.02 
 
 		 716 aa  92  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  26.32 
 
 		 769 aa  91.3  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  25.15 
 
 		 759 aa  91.3  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  25.15 
 
 		 759 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  32.29 
 
 		 901 aa  90.9  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  25.44 
 
 		 759 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  25.44 
 
 		 769 aa  90.9  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1126 aa  90.1  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  24.85 
 
 		 759 aa  89.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  24.85 
 
 		 759 aa  89.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  29.97 
 
 		 686 aa  89  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  27.19 
 
 		 1284 aa  89.4  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1116 aa  88.6  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  25.22 
 
 		 759 aa  87.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  27.45 
 
 		 2245 aa  87.8  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  25.63 
 
 		 1190 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  28.74 
 
 		 606 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  29.93 
 
 		 795 aa  87  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  25.33 
 
 		 1212 aa  85.5  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  29.05 
 
 		 1185 aa  84.3  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  27.94 
 
 		 1097 aa  84.3  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  26.7 
 
 		 1175 aa  81.6  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  23.71 
 
 		 1137 aa  76.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  27.69 
 
 		 1408 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  28.07 
 
 		 715 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1118 aa  76.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  25.5 
 
 		 1111 aa  74.7  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  26.71 
 
 		 958 aa  74.7  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  25.52 
 
 		 2310 aa  72.8  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  25 
 
 		 944 aa  72.8  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  28.89 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  30.48 
 
 		 1280 aa  68.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  24.32 
 
 		 1171 aa  68.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.58 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.84 
 
 		 932 aa  68.6  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49919  predicted protein  28.32 
 
 		 1040 aa  67.4  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.099413  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2944  serine/threonine kinase protein  31.58 
 
 		 762 aa  67  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  24.41 
 
 		 975 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  28.31 
 
 		 237 aa  65.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.01 
 
 		 1428 aa  65.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  26.32 
 
 		 1041 aa  65.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1172 aa  65.5  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  26.33 
 
 		 946 aa  65.9  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  25.62 
 
 		 1178 aa  65.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  24.44 
 
 		 906 aa  65.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>