101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  100 
 
 		 1212 aa  2496    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  32.22 
 
 		 1175 aa  555  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  30.34 
 
 		 1190 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  27.92 
 
 		 1137 aa  249  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.49 
 
 		 585 aa  121  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  27.83 
 
 		 1099 aa  98.6  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  24.25 
 
 		 941 aa  92.8  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  22.52 
 
 		 716 aa  91.3  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  28.92 
 
 		 466 aa  90.9  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  26.27 
 
 		 1653 aa  88.6  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  32.87 
 
 		 632 aa  88.2  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1018 aa  85.9  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  24.3 
 
 		 1126 aa  85.9  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  25.83 
 
 		 1585 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  25.83 
 
 		 1585 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  26.49 
 
 		 1284 aa  82.8  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  31.25 
 
 		 636 aa  82  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  31.51 
 
 		 636 aa  81.6  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  29.47 
 
 		 611 aa  79.7  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  29.15 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  29.22 
 
 		 635 aa  76.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  30.32 
 
 		 553 aa  75.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  30.32 
 
 		 553 aa  75.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  21.72 
 
 		 748 aa  75.9  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  26.37 
 
 		 1077 aa  74.7  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  22.74 
 
 		 1422 aa  73.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  25.62 
 
 		 1284 aa  73.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  22.34 
 
 		 609 aa  73.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.61 
 
 		 1620 aa  71.6  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  21.38 
 
 		 1111 aa  71.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  32.06 
 
 		 254 aa  71.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  27.27 
 
 		 952 aa  70.1  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  29.58 
 
 		 754 aa  70.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  28.3 
 
 		 797 aa  69.7  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  29.03 
 
 		 622 aa  69.7  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  28.97 
 
 		 619 aa  69.3  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  25.88 
 
 		 633 aa  69.3  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  26.67 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.44 
 
 		 1097 aa  68.6  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  28.97 
 
 		 622 aa  68.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  30.09 
 
 		 651 aa  68.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  31.8 
 
 		 1189 aa  67  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  22.19 
 
 		 1108 aa  66.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  31.88 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  23.75 
 
 		 633 aa  66.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  26.79 
 
 		 237 aa  66.6  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  30.99 
 
 		 2245 aa  65.5  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  27.54 
 
 		 643 aa  65.5  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  28.96 
 
 		 1999 aa  65.1  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  26.73 
 
 		 1090 aa  64.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 2310 aa  63.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  24.61 
 
 		 633 aa  63.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  25.1 
 
 		 633 aa  63.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.65 
 
 		 752 aa  63.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  27.07 
 
 		 1651 aa  62.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  26.85 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  27.31 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  22.88 
 
 		 1038 aa  59.7  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  26.02 
 
 		 655 aa  59.3  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  26.34 
 
 		 315 aa  57.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  22.48 
 
 		 606 aa  55.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  25.94 
 
 		 795 aa  53.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  26.36 
 
 		 486 aa  53.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  27.88 
 
 		 686 aa  52.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  26.2 
 
 		 268 aa  52.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  27.91 
 
 		 2005 aa  52.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  22.86 
 
 		 283 aa  52  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  45.45 
 
 		 1408 aa  52.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  28.48 
 
 		 1427 aa  52  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  23.16 
 
 		 2098 aa  51.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  25.49 
 
 		 629 aa  50.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1139 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1118 aa  50.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  23.16 
 
 		 2101 aa  49.7  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  23.16 
 
 		 2101 aa  49.7  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  25 
 
 		 1163 aa  50.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2944  serine/threonine kinase protein  42.86 
 
 		 762 aa  49.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  28.7 
 
 		 1153 aa  49.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  26.29 
 
 		 1151 aa  48.5  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  25.93 
 
 		 1198 aa  48.5  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  29.73 
 
 		 2125 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1126 aa  47.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  29.73 
 
 		 2125 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  43.64 
 
 		 1428 aa  47.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  24.21 
 
 		 2104 aa  47  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  21.4 
 
 		 715 aa  47.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  24.89 
 
 		 1082 aa  47.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1121 aa  46.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  34.07 
 
 		 1048 aa  46.2  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  28 
 
 		 1280 aa  46.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  32.63 
 
 		 1143 aa  45.8  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  32.63 
 
 		 1143 aa  45.8  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  24.79 
 
 		 659 aa  46.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  26.24 
 
 		 579 aa  45.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1116 aa  45.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  38.57 
 
 		 914 aa  45.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1172 aa  45.1  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  41.82 
 
 		 1143 aa  45.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.05 
 
 		 1203 aa  45.1  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  23.21 
 
 		 759 aa  45.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>