186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4472 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  41.73 
 
 		 1270 aa  776    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  47.86 
 
 		 1250 aa  969    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  40.12 
 
 		 1153 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  47.47 
 
 		 1324 aa  706    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  43.15 
 
 		 1196 aa  779    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  72.58 
 
 		 1143 aa  1587    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  39.19 
 
 		 1247 aa  691    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  46.41 
 
 		 1215 aa  875    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  72.58 
 
 		 1143 aa  1587    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  100 
 
 		 1151 aa  2320    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  48.81 
 
 		 1228 aa  952    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  72.32 
 
 		 1143 aa  1585    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  82.52 
 
 		 1163 aa  1904    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  45.95 
 
 		 1215 aa  867    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  64.73 
 
 		 1139 aa  1441    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  37.81 
 
 		 1198 aa  567  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  38.25 
 
 		 1082 aa  530  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  34.35 
 
 		 1126 aa  501  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  32.7 
 
 		 1118 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  45.77 
 
 		 1350 aa  479  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  32.83 
 
 		 1116 aa  476  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1172 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  35.2 
 
 		 1175 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  41.65 
 
 		 522 aa  346  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  39.64 
 
 		 1280 aa  318  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  43.07 
 
 		 1121 aa  244  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  31.69 
 
 		 934 aa  124  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  28.87 
 
 		 606 aa  110  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  29.07 
 
 		 1271 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  27.51 
 
 		 486 aa  104  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  30.32 
 
 		 902 aa  103  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1259 aa  103  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  30.59 
 
 		 480 aa  99.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  26.2 
 
 		 1048 aa  96.3  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  25.31 
 
 		 494 aa  96.3  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  26.3 
 
 		 636 aa  94.7  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1275 aa  94  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  27.64 
 
 		 902 aa  94  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  26.54 
 
 		 1255 aa  92.4  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  31.1 
 
 		 553 aa  91.7  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  31.1 
 
 		 553 aa  91.7  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  28.57 
 
 		 986 aa  90.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  29.04 
 
 		 901 aa  90.1  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25.19 
 
 		 1038 aa  87.8  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  25.06 
 
 		 512 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.22 
 
 		 752 aa  85.9  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  25.51 
 
 		 632 aa  85.5  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  24.12 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  26.77 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  26.77 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  24.89 
 
 		 1090 aa  80.9  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  26.93 
 
 		 1097 aa  80.9  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  25.86 
 
 		 390 aa  81.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  26.17 
 
 		 1099 aa  79.7  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  25.47 
 
 		 635 aa  79.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  26.82 
 
 		 1427 aa  79.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  24.79 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.92 
 
 		 932 aa  78.2  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  24.75 
 
 		 1077 aa  77.4  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  31.15 
 
 		 659 aa  77.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  29.37 
 
 		 521 aa  77  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  23.6 
 
 		 486 aa  76.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  28.63 
 
 		 609 aa  75.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  22.49 
 
 		 611 aa  75.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  25.81 
 
 		 512 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  24.11 
 
 		 797 aa  73.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  24.2 
 
 		 1653 aa  72.4  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  26.01 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  25.1 
 
 		 629 aa  71.2  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  29.43 
 
 		 1189 aa  70.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  26.85 
 
 		 925 aa  70.1  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  24.49 
 
 		 1999 aa  70.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  27.25 
 
 		 464 aa  70.1  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.26 
 
 		 922 aa  70.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  25.93 
 
 		 1620 aa  70.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  48.57 
 
 		 193 aa  68.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  25.29 
 
 		 650 aa  68.2  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  25.29 
 
 		 650 aa  67.8  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  26.54 
 
 		 916 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  29.05 
 
 		 914 aa  67.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  28.35 
 
 		 2245 aa  66.2  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  23.82 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  23.51 
 
 		 633 aa  65.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  28.19 
 
 		 651 aa  65.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  26.52 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  21.24 
 
 		 759 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  26.28 
 
 		 716 aa  65.5  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.73 
 
 		 1203 aa  65.1  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  21.38 
 
 		 759 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  21.12 
 
 		 759 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  21.38 
 
 		 759 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.2 
 
 		 1111 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  23.71 
 
 		 495 aa  63.5  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  21.34 
 
 		 759 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  23.81 
 
 		 1261 aa  62.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  21.48 
 
 		 769 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  22.01 
 
 		 769 aa  62.4  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  21.12 
 
 		 759 aa  62.4  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  21.03 
 
 		 759 aa  62  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  21.43 
 
 		 643 aa  62  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>