72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2072 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2072  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.506515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  77.93 
 
 		 1584 aa  362  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.64 
 
 		 1196 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  41.76 
 
 		 611 aa  55.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  34.92 
 
 		 759 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  34.13 
 
 		 759 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  34.13 
 
 		 769 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  33.08 
 
 		 769 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  31.9 
 
 		 903 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  34.13 
 
 		 759 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  34.13 
 
 		 759 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  34.13 
 
 		 759 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  34.13 
 
 		 759 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  33.64 
 
 		 941 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  33.33 
 
 		 759 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  33.33 
 
 		 759 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 759 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  35.71 
 
 		 1185 aa  52.4  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  31.25 
 
 		 932 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  34.55 
 
 		 925 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  36.9 
 
 		 1041 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.2 
 
 		 629 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  29.47 
 
 		 946 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  31.18 
 
 		 906 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  27.75 
 
 		 1999 aa  49.7  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  33.71 
 
 		 1261 aa  48.5  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  31.71 
 
 		 655 aa  48.5  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  31.25 
 
 		 1403 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  29.73 
 
 		 1056 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  27.5 
 
 		 905 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  27.5 
 
 		 905 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  30.34 
 
 		 914 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  31.82 
 
 		 585 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  32.63 
 
 		 975 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  31.3 
 
 		 633 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  27.08 
 
 		 922 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  35.35 
 
 		 643 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  33.03 
 
 		 633 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  30.59 
 
 		 1099 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  31.71 
 
 		 1457 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  29.84 
 
 		 905 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  29.75 
 
 		 1427 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  32.11 
 
 		 2245 aa  45.4  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  29.6 
 
 		 905 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  35.59 
 
 		 958 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  30.19 
 
 		 908 aa  45.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  30.95 
 
 		 1189 aa  45.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  35.11 
 
 		 633 aa  45.1  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  25.71 
 
 		 1094 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  26.95 
 
 		 905 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  27.55 
 
 		 916 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  34.33 
 
 		 1220 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  28.21 
 
 		 907 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  28.77 
 
 		 632 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  30.84 
 
 		 1280 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1018 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  33.66 
 
 		 904 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  25.71 
 
 		 1284 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  32.97 
 
 		 754 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1049 aa  42.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  26.32 
 
 		 1087 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  30.23 
 
 		 633 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  29.06 
 
 		 748 aa  42.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  34.44 
 
 		 914 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  34.94 
 
 		 650 aa  42.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  34.94 
 
 		 650 aa  42.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  27.35 
 
 		 900 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  29.58 
 
 		 635 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  37.36 
 
 		 606 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  32.38 
 
 		 797 aa  41.6  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  33.71 
 
 		 609 aa  41.6  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.25 
 
 		 254 aa  41.6  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>