172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1790 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1427 aa  2849    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  44.84 
 
 		 1403 aa  1151    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  43.26 
 
 		 1457 aa  1041    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  28.65 
 
 		 1261 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1275 aa  197  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1259 aa  196  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  30.06 
 
 		 1271 aa  162  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  27.95 
 
 		 1255 aa  145  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  29.31 
 
 		 1408 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.17 
 
 		 1428 aa  134  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  29.67 
 
 		 986 aa  104  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  28.1 
 
 		 606 aa  104  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  28.7 
 
 		 902 aa  94.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  24.95 
 
 		 632 aa  91.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25.71 
 
 		 636 aa  89  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.49 
 
 		 635 aa  88.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  29.13 
 
 		 622 aa  87.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  28.08 
 
 		 1270 aa  86.7  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  28.45 
 
 		 619 aa  86.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  26.82 
 
 		 1163 aa  85.9  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  29.25 
 
 		 622 aa  85.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  27.64 
 
 		 1958 aa  84.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  27.37 
 
 		 1950 aa  83.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  24.95 
 
 		 934 aa  82.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.73 
 
 		 629 aa  82.4  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  23.6 
 
 		 797 aa  82.8  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  28.1 
 
 		 902 aa  82  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  26.67 
 
 		 754 aa  81.6  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  25 
 
 		 1077 aa  81.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  25.25 
 
 		 952 aa  80.1  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  25.1 
 
 		 633 aa  80.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  26.82 
 
 		 1151 aa  79.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  24.89 
 
 		 759 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  24.91 
 
 		 609 aa  79.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  23.58 
 
 		 1048 aa  79  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  23.95 
 
 		 759 aa  79  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  23.06 
 
 		 636 aa  78.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  24.89 
 
 		 759 aa  78.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  24.26 
 
 		 759 aa  77  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  24.89 
 
 		 759 aa  77.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  24.07 
 
 		 1090 aa  77.4  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  24.26 
 
 		 759 aa  77  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  24.26 
 
 		 759 aa  77.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  23.08 
 
 		 611 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  23.17 
 
 		 769 aa  77.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  27.06 
 
 		 1250 aa  76.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  24.73 
 
 		 748 aa  76.6  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  21.74 
 
 		 643 aa  75.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  28.8 
 
 		 2198 aa  75.1  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1118 aa  75.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  25.21 
 
 		 1097 aa  74.7  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  24.47 
 
 		 769 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  25.39 
 
 		 633 aa  74.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  24.68 
 
 		 759 aa  74.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.3 
 
 		 1196 aa  73.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  25.86 
 
 		 1143 aa  73.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  27.21 
 
 		 1228 aa  73.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  24.05 
 
 		 759 aa  73.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  25.17 
 
 		 1143 aa  72.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  25.17 
 
 		 1143 aa  72.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  26.87 
 
 		 901 aa  71.6  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  26.6 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.27 
 
 		 1324 aa  71.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  23.74 
 
 		 633 aa  71.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  25.41 
 
 		 466 aa  70.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25.9 
 
 		 1038 aa  70.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  26.26 
 
 		 650 aa  70.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1215 aa  70.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  27.37 
 
 		 903 aa  70.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  27.29 
 
 		 1082 aa  68.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  27.61 
 
 		 2013 aa  68.6  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  25 
 
 		 655 aa  68.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  29.05 
 
 		 1980 aa  67.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  28.65 
 
 		 1803 aa  67  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  28.32 
 
 		 1697 aa  67.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  27.19 
 
 		 1196 aa  67.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1126 aa  66.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1139 aa  66.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1215 aa  65.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  30.95 
 
 		 651 aa  65.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  28.95 
 
 		 2207 aa  65.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1116 aa  65.1  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  24.76 
 
 		 716 aa  65.1  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  24.49 
 
 		 686 aa  64.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  31.82 
 
 		 752 aa  64.3  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  23.56 
 
 		 633 aa  63.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1172 aa  63.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  27.54 
 
 		 1991 aa  63.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  23.63 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  26.92 
 
 		 659 aa  62.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1247 aa  62.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  27.61 
 
 		 946 aa  62  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  28 
 
 		 1986 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  27.9 
 
 		 2002 aa  60.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  28.21 
 
 		 1973 aa  60.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  26.95 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  27.27 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  26.38 
 
 		 1945 aa  58.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1822 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  23.99 
 
 		 1622 aa  58.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>