122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1720 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  42.78 
 
 		 1275 aa  1057    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  37.96 
 
 		 1255 aa  745    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  100 
 
 		 1259 aa  2538    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  48.35 
 
 		 1271 aa  1115    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  25.22 
 
 		 1427 aa  202  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  31.58 
 
 		 1457 aa  169  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  26.96 
 
 		 1261 aa  163  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  27.83 
 
 		 1403 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1126 aa  127  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1215 aa  127  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  31.53 
 
 		 1250 aa  122  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  31.02 
 
 		 606 aa  121  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1118 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1116 aa  118  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1215 aa  114  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  27.55 
 
 		 1408 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  30.22 
 
 		 1151 aa  110  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  31.92 
 
 		 1324 aa  108  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1172 aa  106  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  29.05 
 
 		 1270 aa  104  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  29.37 
 
 		 1143 aa  101  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  29.37 
 
 		 1143 aa  101  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1139 aa  101  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  28.37 
 
 		 1163 aa  100  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  27.59 
 
 		 1153 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  29.37 
 
 		 1143 aa  100  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.74 
 
 		 1428 aa  98.2  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  27.81 
 
 		 1196 aa  97.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  26.03 
 
 		 486 aa  96.7  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  28.7 
 
 		 1198 aa  95.1  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  29.9 
 
 		 1228 aa  93.2  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  30.42 
 
 		 1121 aa  92.8  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1247 aa  91.7  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  27.51 
 
 		 1082 aa  91.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1350 aa  89  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  26.78 
 
 		 986 aa  88.2  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  31.53 
 
 		 651 aa  81.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  26.83 
 
 		 902 aa  80.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1175 aa  80.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  26.56 
 
 		 934 aa  79.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.84 
 
 		 636 aa  79.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  26.02 
 
 		 1280 aa  79  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  24.31 
 
 		 1048 aa  78.6  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.29 
 
 		 1097 aa  78.6  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  28.37 
 
 		 748 aa  77.8  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.67 
 
 		 752 aa  77  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  23.87 
 
 		 716 aa  75.5  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  27.34 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  34.31 
 
 		 619 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  23.92 
 
 		 797 aa  74.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  33.94 
 
 		 622 aa  74.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  27.14 
 
 		 650 aa  73.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  27.14 
 
 		 650 aa  73.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  34.31 
 
 		 622 aa  72  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  26.03 
 
 		 902 aa  71.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  26.23 
 
 		 1111 aa  71.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  25.91 
 
 		 901 aa  70.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  23.16 
 
 		 655 aa  67.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  28.93 
 
 		 636 aa  65.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  25.38 
 
 		 629 aa  63.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10841  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  26.73 
 
 		 574 aa  63.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0105439  normal  0.293224 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25.33 
 
 		 1999 aa  63.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25.44 
 
 		 609 aa  62.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  25.66 
 
 		 686 aa  62.4  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  24.09 
 
 		 1077 aa  62.4  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  29.69 
 
 		 530 aa  61.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  22.85 
 
 		 1090 aa  60.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  26.45 
 
 		 632 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  22.97 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  27.92 
 
 		 611 aa  58.5  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  24.83 
 
 		 754 aa  58.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  23.69 
 
 		 633 aa  55.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  23.43 
 
 		 633 aa  55.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  23.33 
 
 		 633 aa  55.5  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  24.69 
 
 		 1585 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  25.37 
 
 		 795 aa  53.5  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  26.22 
 
 		 553 aa  54.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  26.22 
 
 		 553 aa  54.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  24.69 
 
 		 1585 aa  54.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  27.42 
 
 		 1189 aa  53.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  21.96 
 
 		 1038 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  25.5 
 
 		 635 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1847  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.68 
 
 		 683 aa  53.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.401727  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.39 
 
 		 526 aa  52.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.28 
 
 		 1196 aa  53.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  25.22 
 
 		 715 aa  52.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  28.06 
 
 		 922 aa  52  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  22.4 
 
 		 1137 aa  51.6  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  22.81 
 
 		 633 aa  50.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  26.5 
 
 		 268 aa  51.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  24.28 
 
 		 2245 aa  50.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14781  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  25.68 
 
 		 573 aa  50.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.922098  normal  0.231202 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  26.46 
 
 		 576 aa  50.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  25.33 
 
 		 464 aa  50.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0646  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.55 
 
 		 573 aa  50.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.547153  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  25.16 
 
 		 1620 aa  49.7  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  26.8 
 
 		 479 aa  50.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  23.95 
 
 		 1099 aa  49.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  25.94 
 
 		 952 aa  48.5  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  24.06 
 
 		 315 aa  48.5  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>