173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2456 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  37.02 
 
 		 1350 aa  637    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  40.03 
 
 		 1250 aa  747    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  38.43 
 
 		 1270 aa  647    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  39.29 
 
 		 1143 aa  651    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  38.39 
 
 		 1215 aa  685    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  39.29 
 
 		 1143 aa  651    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  39.52 
 
 		 1151 aa  695    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  40.92 
 
 		 1196 aa  699    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  39.07 
 
 		 1143 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  38.52 
 
 		 1163 aa  675    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1139 aa  671    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  37.49 
 
 		 1215 aa  696    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  100 
 
 		 1247 aa  2507    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  40.27 
 
 		 1228 aa  738    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  41.42 
 
 		 1324 aa  559  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  36.06 
 
 		 1153 aa  555  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  36.62 
 
 		 1198 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1118 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1116 aa  393  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1175 aa  364  6e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  36.29 
 
 		 1280 aa  302  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  36.66 
 
 		 522 aa  296  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  43.64 
 
 		 1082 aa  258  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  35.85 
 
 		 1172 aa  246  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1126 aa  222  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  40.67 
 
 		 1121 aa  211  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  28.05 
 
 		 606 aa  111  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  28.61 
 
 		 934 aa  108  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  27.15 
 
 		 1271 aa  108  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  27.85 
 
 		 986 aa  107  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  27.9 
 
 		 902 aa  105  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  27.37 
 
 		 902 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  28.03 
 
 		 1255 aa  100  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  27.39 
 
 		 486 aa  96.3  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  24.94 
 
 		 901 aa  90.5  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1259 aa  88.2  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1275 aa  85.5  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.98 
 
 		 752 aa  84.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.92 
 
 		 629 aa  82  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  23.69 
 
 		 1048 aa  80.1  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  25.66 
 
 		 1653 aa  79  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  22.95 
 
 		 585 aa  78.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  29.02 
 
 		 553 aa  77.8  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  29.02 
 
 		 553 aa  77.8  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  25.27 
 
 		 480 aa  76.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.61 
 
 		 932 aa  75.5  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  23.32 
 
 		 487 aa  75.1  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  26.34 
 
 		 922 aa  75.1  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  23.08 
 
 		 512 aa  74.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  25.81 
 
 		 479 aa  73.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  27.24 
 
 		 1189 aa  73.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  23.46 
 
 		 1097 aa  72  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  25.66 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  21.52 
 
 		 493 aa  71.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  21.52 
 
 		 493 aa  71.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  25.95 
 
 		 916 aa  71.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  20.84 
 
 		 512 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5628  hypothetical protein  28.91 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431962  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5800  hypothetical protein  28.91 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000132526 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  26.13 
 
 		 797 aa  68.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  24.32 
 
 		 650 aa  68.9  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  26.35 
 
 		 609 aa  68.6  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25.64 
 
 		 1999 aa  68.6  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  24.32 
 
 		 650 aa  68.2  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  20.96 
 
 		 1077 aa  67.8  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  23.48 
 
 		 925 aa  66.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  23.44 
 
 		 632 aa  66.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  31.13 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.62 
 
 		 1203 aa  65.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  26.92 
 
 		 759 aa  65.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  25.39 
 
 		 2245 aa  65.5  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  27.65 
 
 		 759 aa  65.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  27.01 
 
 		 759 aa  65.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  25.18 
 
 		 521 aa  65.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  26.69 
 
 		 759 aa  65.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  26.69 
 
 		 759 aa  65.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  25.94 
 
 		 636 aa  65.1  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  41.77 
 
 		 193 aa  65.1  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  22.61 
 
 		 494 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  26.92 
 
 		 759 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  27.01 
 
 		 759 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  23.39 
 
 		 1038 aa  64.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  26.69 
 
 		 759 aa  64.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  26.69 
 
 		 769 aa  64.3  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  26.69 
 
 		 759 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3949  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.21 
 
 		 434 aa  63.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0000319399  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  22.22 
 
 		 655 aa  64.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  24.54 
 
 		 795 aa  63.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  22.99 
 
 		 686 aa  62.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  23.28 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  24.67 
 
 		 1457 aa  62.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1176 aa  62.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  25.55 
 
 		 1427 aa  62.4  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  22.73 
 
 		 1099 aa  62.4  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  24.56 
 
 		 464 aa  62  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  22.9 
 
 		 1403 aa  62  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  25.26 
 
 		 758 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  20.97 
 
 		 1090 aa  61.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  23.23 
 
 		 754 aa  61.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  24.19 
 
 		 1620 aa  61.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>