14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1671 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1671  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  183  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4529  hypothetical protein  35.63 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396695  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23020  hypothetical protein  41.98 
 
 
295 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1220  hypothetical protein  34.25 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1238  protein of unknown function DUF559  34.25 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0282  hypothetical protein  31.17 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1094  hypothetical protein  32.88 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.090836  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0163  hypothetical protein  31.25 
 
 
194 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103977  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1076  hypothetical protein  28.75 
 
 
194 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000229233  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2461  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  32.86 
 
 
1403 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3917  hypothetical protein  36 
 
 
154 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0131192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1705  hypothetical protein  32.86 
 
 
1421 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0541  hypothetical protein  30.38 
 
 
225 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.164679  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2356  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0831458  normal  0.14274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>