More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0088 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  100 
 
 		 373 aa  753    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  68.51 
 
 		 368 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4446  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  70.08 
 
 		 367 aa  521  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0290  ABC transporter related  69.89 
 
 		 367 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  70.17 
 
 		 367 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  69.89 
 
 		 367 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  70.99 
 
 		 367 aa  524  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0280  ABC transporter related  70.91 
 
 		 367 aa  524  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000359187 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  69.61 
 
 		 367 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0279  ABC transporter related  70.08 
 
 		 367 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167644 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3742  ABC transporter related  70.08 
 
 		 367 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4395  ABC transporter-related protein  67.58 
 
 		 369 aa  512  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  hitchhiker  0.0000262843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  66.48 
 
 		 369 aa  511  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4786  ABC transporter related  67.13 
 
 		 368 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00107272  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  65.47 
 
 		 370 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  47.53 
 
 		 375 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1923  ABC transporter related  41.76 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1393  ABC transporter related  43.01 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  38.69 
 
 		 368 aa  249  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  36.74 
 
 		 380 aa  226  6e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  38.89 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 		 385 aa  222  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  48.07 
 
 		 241 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  35.98 
 
 		 380 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  35.49 
 
 		 380 aa  215  8e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  35.65 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  35.88 
 
 		 357 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1822  ABC transporter related  36.71 
 
 		 370 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  49.01 
 
 		 359 aa  195  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  38.2 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  38.91 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.52 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 		 355 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  35.91 
 
 		 343 aa  189  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  43.53 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.86 
 
 		 354 aa  186  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 375 aa  186  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 375 aa  186  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  33.12 
 
 		 352 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  37.04 
 
 		 405 aa  186  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 333 aa  185  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  36.06 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.93 
 
 		 346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  40.15 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.92 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.95 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4252  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.06 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 357 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 339 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  36.13 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.56 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  36.21 
 
 		 366 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  41.28 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  36.88 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.38 
 
 		 386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.38 
 
 		 386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 		 346 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.91 
 
 		 374 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 333 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.47 
 
 		 359 aa  182  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  38.68 
 
 		 353 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 330 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  47.47 
 
 		 386 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.78 
 
 		 330 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  41.38 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  33.6 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  43.5 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.22 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.56 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.77 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.25 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.81 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  36.02 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  37.58 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.19 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.42 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  43.69 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  43.14 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  42.36 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 366 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 		 357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2499  ABC transporter related  37.68 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  41.99 
 
 		 360 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 330 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  35.63 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>