More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2038 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  100 
 
 
384 aa  758    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  53.03 
 
 
354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  51.74 
 
 
347 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  51.44 
 
 
354 aa  318  9e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.77 
 
 
343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  50.14 
 
 
402 aa  312  6.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  52.45 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  51.42 
 
 
352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  47.76 
 
 
385 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  48.58 
 
 
349 aa  276  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  51.18 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  43.24 
 
 
372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  45.38 
 
 
358 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  45.38 
 
 
358 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  45.38 
 
 
358 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  41.55 
 
 
369 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  42.02 
 
 
367 aa  209  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  40.82 
 
 
358 aa  206  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  45.27 
 
 
346 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  53.51 
 
 
247 aa  202  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  34.58 
 
 
347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  41.39 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  41.39 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  41.39 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  41.96 
 
 
347 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  41.23 
 
 
347 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3375  ABC transporter ATP-binding protein  49.31 
 
 
331 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.734729 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4786  ABC transporter related  45.16 
 
 
368 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00107272  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  41.94 
 
 
353 aa  196  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  44.54 
 
 
371 aa  195  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  38.23 
 
 
357 aa  195  9e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  31.85 
 
 
348 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4175  ABC transporter related  47.3 
 
 
391 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  40.18 
 
 
349 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.08 
 
 
373 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.8 
 
 
366 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  37.68 
 
 
354 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  36.55 
 
 
355 aa  193  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41 
 
 
352 aa  193  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.16 
 
 
366 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  46.84 
 
 
367 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.45 
 
 
374 aa  192  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1606  ABC transporter related  40.3 
 
 
394 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256543  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  38.03 
 
 
358 aa  192  8e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  44.27 
 
 
337 aa  192  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.22 
 
 
423 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4446  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
367 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4319  ABC transporter-related protein  43.43 
 
 
364 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.34288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.06 
 
 
371 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 
354 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  36.72 
 
 
353 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  40.78 
 
 
344 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  46.41 
 
 
367 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3268  ABC transporter related  39.51 
 
 
367 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.49 
 
 
380 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.24 
 
 
366 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  37.5 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0279  ABC transporter related  44.76 
 
 
367 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000167644 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3742  ABC transporter related  44.76 
 
 
367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0280  ABC transporter related  44.35 
 
 
367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000359187 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  39.23 
 
 
349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  46.84 
 
 
367 aa  190  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1785  ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 
347 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  43.12 
 
 
368 aa  190  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  40.86 
 
 
363 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.22 
 
 
388 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  39.41 
 
 
362 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0353  ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 
347 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  40.86 
 
 
363 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0607  ABC transporter related  33.14 
 
 
397 aa  189  5e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0567231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 
369 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  39.36 
 
 
352 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1011  ABC transporter related  40.58 
 
 
358 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0118273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  41.08 
 
 
356 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.22 
 
 
388 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.39 
 
 
357 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.22 
 
 
388 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1308  ABC transporter related  41.95 
 
 
353 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  43.14 
 
 
373 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.68 
 
 
349 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
353 aa  189  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.18 
 
 
352 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  43.01 
 
 
632 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  38.37 
 
 
388 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.79 
 
 
349 aa  189  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.24 
 
 
371 aa  189  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.25 
 
 
387 aa  189  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  39.18 
 
 
352 aa  189  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.78 
 
 
353 aa  189  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0682  ABC transporter-like protein  46.55 
 
 
337 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  45.99 
 
 
367 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.88 
 
 
359 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.3 
 
 
349 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  38.35 
 
 
360 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  44.1 
 
 
375 aa  189  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0297  ABC transporter related  46.79 
 
 
359 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.292775  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3533  ABC transporter related  41.92 
 
 
372 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  35.42 
 
 
351 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
353 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  41.42 
 
 
371 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>