More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3375 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3375  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 331 aa  678    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.734729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3533  ABC transporter related  68.92 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1011  ABC transporter related  62.87 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0118273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3268  ABC transporter related  62.28 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2473  ABC transporter related  63.36 
 
 		 356 aa  411  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3338  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  63.3 
 
 		 325 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3942  ABC transporter related  62.16 
 
 		 331 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311747 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4064  ABC transporter related  63.08 
 
 		 325 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1362  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  59.94 
 
 		 352 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5903  ABC transporter related  60.24 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5256  ABC transporter related  59.17 
 
 		 352 aa  394  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.336251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0209  ABC transporter-related protein  63 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2894  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.06 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4738  ABC transporter related  59.82 
 
 		 329 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3637  hypothetical protein  61.47 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0100  ABC transporter related  58.91 
 
 		 329 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1727  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6279  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  54.31 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2659  ABC transporter related  53.22 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2920  ABC transporter related  52.12 
 
 		 363 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.905219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7132  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  56.07 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1908  ABC transporter ATP-binding protein  50.82 
 
 		 368 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7092  ABC transporter related  43.3 
 
 		 387 aa  271  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106736  normal  0.0652962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.21 
 
 		 387 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 		 327 aa  268  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0326  ABC transporter related  43.27 
 
 		 372 aa  267  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1497  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.3 
 
 		 383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 331 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  48.19 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  52.14 
 
 		 353 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 		 327 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3271  ABC transporter related  42.9 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.800565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.12 
 
 		 423 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1733  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.79 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  41.74 
 
 		 350 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  52.5 
 
 		 367 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1525  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 337 aa  258  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2218  ABC transporter related  43.84 
 
 		 337 aa  258  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  51.71 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1620  ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01398  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  43.54 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2205  ABC transporter related protein  43.54 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0635476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01409  hypothetical protein  43.54 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2046  ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000987436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4279  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.95 
 
 		 372 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.714289  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  53.97 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.36 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.43 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.4 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 		 388 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  44.76 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 353 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.18 
 
 		 378 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.55 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.4 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 344 aa  252  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.16 
 
 		 365 aa  252  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  49.08 
 
 		 363 aa  252  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.62 
 
 		 377 aa  252  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  54.01 
 
 		 341 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  51.24 
 
 		 357 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  45.9 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  52.38 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  49.59 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.44 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  49.39 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.9 
 
 		 384 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.48 
 
 		 377 aa  250  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  50.83 
 
 		 357 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  48.54 
 
 		 363 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  50.2 
 
 		 367 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.62 
 
 		 343 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  43.48 
 
 		 358 aa  249  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.58 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  51.25 
 
 		 348 aa  248  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.45 
 
 		 399 aa  248  9e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  49.17 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  51.3 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.37 
 
 		 426 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  48.13 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  41.96 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  43.17 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  48.13 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  48.13 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.54 
 
 		 345 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  48.72 
 
 		 360 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  49.8 
 
 		 360 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  49.8 
 
 		 360 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>