More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2904 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  100 
 
 
371 aa  713    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  59.49 
 
 
346 aa  343  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  55.37 
 
 
358 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  53.55 
 
 
367 aa  325  9e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  52.51 
 
 
369 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  53.41 
 
 
361 aa  309  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  54.39 
 
 
358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  54.39 
 
 
358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  54.39 
 
 
358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2536  ABC transporter-related protein  56.34 
 
 
359 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3861  ABC transporter related  58.07 
 
 
358 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4175  ABC transporter related  59.5 
 
 
391 aa  296  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  52.1 
 
 
372 aa  292  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  50.14 
 
 
347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4507  ABC transporter related protein  50.14 
 
 
367 aa  265  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  47.85 
 
 
354 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.68 
 
 
343 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  45.95 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  46.47 
 
 
354 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  46.18 
 
 
402 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  46.65 
 
 
350 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  44.32 
 
 
385 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1233  ABC transporter related  49.86 
 
 
361 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.642029  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  45.56 
 
 
352 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  44.54 
 
 
384 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2304  ABC transporter related protein  56.58 
 
 
335 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  44.41 
 
 
349 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  42.61 
 
 
344 aa  212  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1851  ABC transporter related  50.97 
 
 
219 aa  209  8e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0521462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  54.23 
 
 
247 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.94 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.87 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  40.18 
 
 
342 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 
327 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.25 
 
 
386 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 
327 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 
331 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  37.76 
 
 
387 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
346 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.31 
 
 
388 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 
327 aa  179  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.11 
 
 
327 aa  179  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.36 
 
 
387 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 
327 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 
327 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  32.72 
 
 
331 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 
331 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  37.59 
 
 
386 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  32.72 
 
 
331 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.6 
 
 
390 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  36.31 
 
 
388 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.31 
 
 
388 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.91 
 
 
387 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3542  ABC transporter related  35.67 
 
 
365 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4663  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.06 
 
 
387 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1263  putrescine transport ATP-binding protein PotG  37.22 
 
 
381 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.77 
 
 
377 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.5 
 
 
388 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.77 
 
 
400 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.86 
 
 
353 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.69 
 
 
423 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3817  polyamine ABC transporter ATP-binding protein  34.67 
 
 
382 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
352 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.11 
 
 
354 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.58 
 
 
380 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.8 
 
 
327 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  38.8 
 
 
378 aa  176  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  40.58 
 
 
364 aa  176  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.91 
 
 
375 aa  175  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1343  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.11 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  33.62 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2088  ABC transporter related  34.38 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.619396  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4361  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.8 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000264978  normal  0.276396 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  35.33 
 
 
388 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.59 
 
 
386 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.59 
 
 
386 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.59 
 
 
386 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.91 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  30.14 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  37.31 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  34.77 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  42.86 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1932  ABC transporter related  33.53 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0195576 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.35 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  36.47 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.3 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.22 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2659  ABC transporter related  40.97 
 
 
374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  41.99 
 
 
330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  33.06 
 
 
371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.31 
 
 
380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  37.29 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  31.39 
 
 
353 aa  173  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  36.07 
 
 
384 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
384 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
384 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  44.25 
 
 
345 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.33 
 
 
356 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>