More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3746 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  100 
 
 
358 aa  697    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  71.82 
 
 
361 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  57.61 
 
 
367 aa  363  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  58.71 
 
 
346 aa  348  6e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  55.37 
 
 
371 aa  320  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  47.17 
 
 
369 aa  292  6e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  49.47 
 
 
372 aa  292  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  48.76 
 
 
358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  48.76 
 
 
358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  48.76 
 
 
358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  48.88 
 
 
347 aa  277  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3861  ABC transporter related  53.15 
 
 
358 aa  269  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2536  ABC transporter-related protein  52.32 
 
 
359 aa  262  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4175  ABC transporter related  54.77 
 
 
391 aa  257  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  44.99 
 
 
402 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.16 
 
 
343 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4507  ABC transporter related protein  45.22 
 
 
367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  43.22 
 
 
347 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  43.02 
 
 
354 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1233  ABC transporter related  47.51 
 
 
361 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.642029  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  42.98 
 
 
354 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  41.9 
 
 
352 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2304  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
335 aa  222  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  41.64 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  43.85 
 
 
349 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  40.87 
 
 
344 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1851  ABC transporter related  49.51 
 
 
219 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0521462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  41.48 
 
 
385 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  42.98 
 
 
350 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.52 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.52 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  31.17 
 
 
353 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.95 
 
 
353 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.83 
 
 
366 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
381 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  40.96 
 
 
354 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  40.91 
 
 
378 aa  169  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4319  ABC transporter-related protein  41.42 
 
 
364 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.34288 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  46.15 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  32.29 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  42.42 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  38.76 
 
 
345 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  40.81 
 
 
377 aa  166  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  43.36 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  32.29 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  40 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  43.17 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  40 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1445  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.37 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.69 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  41.67 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 
369 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  38.24 
 
 
367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.83 
 
 
354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2188  ABC transporter related  41.08 
 
 
331 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0854414 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
387 aa  162  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.14 
 
 
378 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  37.83 
 
 
361 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  42.11 
 
 
359 aa  162  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.51 
 
 
369 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  39.47 
 
 
361 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  38.19 
 
 
395 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.86 
 
 
375 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.86 
 
 
375 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.68 
 
 
375 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  38.52 
 
 
336 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  36.03 
 
 
353 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  37.68 
 
 
356 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.37 
 
 
374 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4194  ABC transporter related  42.51 
 
 
361 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.812216  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.17 
 
 
383 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  37.13 
 
 
360 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  41.45 
 
 
328 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  34.09 
 
 
357 aa  160  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.46 
 
 
363 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.49 
 
 
366 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  42.48 
 
 
353 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  35.43 
 
 
337 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.69 
 
 
371 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  29.41 
 
 
347 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
352 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  27.38 
 
 
353 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  36.84 
 
 
371 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4565  ABC transporter related  41.7 
 
 
361 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
354 aa  159  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 
333 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  37.55 
 
 
368 aa  159  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  38.15 
 
 
353 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2659  ABC transporter related  39.3 
 
 
374 aa  159  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.4 
 
 
357 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1735  ATP-binding component of transport system for maltose  40.36 
 
 
376 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  48.83 
 
 
247 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  42.86 
 
 
353 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  41.41 
 
 
342 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  41.03 
 
 
328 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0465  ABC transporter related  43.1 
 
 
385 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.365708  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  39.01 
 
 
368 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1299  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
394 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0956135  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  38.13 
 
 
336 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  35.23 
 
 
355 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>