More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0465 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0465  ABC transporter related  100 
 
 		 385 aa  744    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.365708  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6152  ABC transporter related  68.63 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  45.43 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  44.68 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  44.59 
 
 		 356 aa  271  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  41.73 
 
 		 360 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  44.75 
 
 		 374 aa  269  8e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  41.76 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  45.24 
 
 		 415 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  43.02 
 
 		 381 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  40.82 
 
 		 355 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  38.75 
 
 		 378 aa  265  8e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  42.25 
 
 		 370 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  41.3 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  41.83 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  42.18 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 368 aa  262  8.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  41.04 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2735  ABC transporter related  44.77 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0408  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.28 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  41.24 
 
 		 362 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  46.36 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  41.42 
 
 		 367 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  41.55 
 
 		 368 aa  258  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0114  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.33 
 
 		 359 aa  258  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  38.59 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1389  ABC transporter related  40.16 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 		 376 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  38.48 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0480  ABC transporter related  45.1 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.53 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  41.21 
 
 		 332 aa  257  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  40.33 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1445  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.91 
 
 		 367 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  39.24 
 
 		 369 aa  256  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  42.39 
 
 		 371 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  39.79 
 
 		 367 aa  256  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.94 
 
 		 377 aa  256  7e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.53 
 
 		 356 aa  255  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  42.11 
 
 		 366 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4736  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 		 365 aa  256  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  40.74 
 
 		 357 aa  255  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  46.71 
 
 		 364 aa  255  8e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.92 
 
 		 351 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0477  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 		 376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  41.4 
 
 		 367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  43.92 
 
 		 357 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  47.16 
 
 		 352 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.53 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.66 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.16 
 
 		 366 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5307  ABC transporter related  43.67 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0629  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.45 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0535  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.79 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5388  ABC transporter related  48.85 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.27 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0566  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.79 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  43.83 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0622  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.27 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.66 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  41.84 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0697  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  38.32 
 
 		 365 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  41.81 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  42.11 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.11 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  39.58 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.11 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  40 
 
 		 356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  40 
 
 		 356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  39.34 
 
 		 366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  42.82 
 
 		 393 aa  253  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  41.27 
 
 		 352 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  41.44 
 
 		 340 aa  253  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  41.21 
 
 		 346 aa  252  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0057  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.66 
 
 		 363 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  37.67 
 
 		 355 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  40.9 
 
 		 333 aa  252  8.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  48.56 
 
 		 368 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5579  ABC transporter related  42.25 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.01 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.67 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  39.95 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  39.78 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  39.47 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  41.21 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  41.67 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.01 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  39.43 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  39.43 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.01 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  38.84 
 
 		 365 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  38.26 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  38.75 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  37.67 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  39.23 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  38.75 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>