More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5307 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5307  ABC transporter related  100 
 
 		 355 aa  709    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  71.99 
 
 		 346 aa  485  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  71.99 
 
 		 346 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  56.41 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  55.71 
 
 		 350 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  49.32 
 
 		 385 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3217  ABC transporter related  52.62 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 373 aa  320  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1389  ABC transporter related  48.35 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  51.63 
 
 		 379 aa  316  5e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.67 
 
 		 378 aa  310  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  47.27 
 
 		 357 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  47.21 
 
 		 350 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  47.21 
 
 		 350 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  47.21 
 
 		 350 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2848  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  47.56 
 
 		 353 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.58 
 
 		 365 aa  305  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  48.9 
 
 		 403 aa  305  8.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  45.23 
 
 		 370 aa  305  9.000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  45.43 
 
 		 349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  43.01 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  47.21 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.43 
 
 		 370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  47.27 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  46.74 
 
 		 361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.19 
 
 		 366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 		 366 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.8 
 
 		 381 aa  302  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 		 366 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  43.21 
 
 		 370 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 		 356 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.5 
 
 		 366 aa  301  9e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 366 aa  301  9e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 366 aa  301  9e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.5 
 
 		 366 aa  301  9e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 366 aa  301  9e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.7 
 
 		 356 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  47.34 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4736  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  43.06 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  42.78 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  46.76 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.94 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  48.2 
 
 		 357 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  44.41 
 
 		 376 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  45.43 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  45.21 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0622  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 		 365 aa  299  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  44.03 
 
 		 353 aa  299  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  45.36 
 
 		 360 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.7 
 
 		 351 aa  299  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  43.58 
 
 		 352 aa  299  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.45 
 
 		 356 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  42.9 
 
 		 370 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  43.17 
 
 		 372 aa  299  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0480  ABC transporter related  44.41 
 
 		 365 aa  298  9e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0477  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.85 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0114  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.37 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  44.85 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.22 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  46.78 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0535  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0566  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  46.74 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  43.21 
 
 		 367 aa  296  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  41.92 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  43.21 
 
 		 367 aa  296  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  45.81 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  41.92 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0629  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.85 
 
 		 376 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  45.92 
 
 		 353 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  44.62 
 
 		 379 aa  296  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  43.48 
 
 		 384 aa  296  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  47.21 
 
 		 357 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0697  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  48.03 
 
 		 334 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  43.29 
 
 		 381 aa  296  4e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  45.9 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  43.61 
 
 		 358 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  43.78 
 
 		 369 aa  295  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  44.63 
 
 		 365 aa  295  6e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  46.76 
 
 		 368 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  44.82 
 
 		 355 aa  295  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  42.78 
 
 		 361 aa  295  7e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3347  ABC transporter related  49.05 
 
 		 343 aa  295  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  44.17 
 
 		 370 aa  295  8e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  44 
 
 		 367 aa  295  9e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7821  ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  41.16 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  47.09 
 
 		 360 aa  295  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  44.54 
 
 		 338 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  44.48 
 
 		 366 aa  295  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  43.98 
 
 		 340 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  46.98 
 
 		 360 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>