More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1948 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  100 
 
 		 344 aa  652    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  61.05 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  59.2 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  59.37 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  60 
 
 		 347 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  59.42 
 
 		 352 aa  359  5e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  59.25 
 
 		 402 aa  358  7e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  59.65 
 
 		 349 aa  349  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  56.61 
 
 		 350 aa  314  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  52.45 
 
 		 384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  48.26 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  43.75 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  45.18 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  56.02 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1657  ABC transporter related  43.42 
 
 		 359 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1591  ABC transporter related  42.2 
 
 		 359 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1610  ABC transporter related  42.2 
 
 		 359 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1206  ABC transporter related  43.09 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1685  ABC transporter related  43.09 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  33.03 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  41.64 
 
 		 359 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4846  ABC transporter, ATPase subunit  39.88 
 
 		 359 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  decreased coverage  0.000133931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  44.8 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  44.8 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  46.74 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  44.8 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  47.71 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.51 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.51 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  34.97 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.51 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  40.5 
 
 		 367 aa  199  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1561  ABC transporter related  40.12 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5537  ABC transporter related  39.52 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  42.12 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  37.61 
 
 		 386 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.91 
 
 		 390 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  41.07 
 
 		 363 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4280  ABC transporter related  41.55 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  38.58 
 
 		 347 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  38.22 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  40.87 
 
 		 358 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  40.62 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.01 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.69 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  34.91 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  46.04 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1300  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2309  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1057  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1787  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2178  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0108  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  34.63 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  41.26 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  35.21 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2122  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.61 
 
 		 387 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 333 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 366 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  39.49 
 
 		 333 aa  188  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  49.53 
 
 		 346 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  49.53 
 
 		 346 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5511  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  41.32 
 
 		 365 aa  189  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  49.53 
 
 		 346 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1108  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  47.88 
 
 		 425 aa  188  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.81433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.81 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  42.45 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  43.67 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.54 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.29 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  43.94 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.22 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1233  ABC transporter related  45.63 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.642029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  43.34 
 
 		 347 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  40.71 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4663  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.4 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  43.35 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  47.47 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  40.4 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3161  ABC transporter related  46.48 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0305522 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.13 
 
 		 355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  43.51 
 
 		 353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.43 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  37.86 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  43.12 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1949  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.415824  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  44.62 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  41.62 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.09 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>