More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2810 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  100 
 
 
367 aa  697    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  57.92 
 
 
346 aa  335  7e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  57.61 
 
 
358 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  54.92 
 
 
347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  56.64 
 
 
361 aa  323  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  53.39 
 
 
372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  52.3 
 
 
358 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  52.3 
 
 
358 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  52.3 
 
 
358 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  53.28 
 
 
371 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  48.51 
 
 
369 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2536  ABC transporter-related protein  53.91 
 
 
359 aa  265  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3861  ABC transporter related  52.85 
 
 
358 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  46.65 
 
 
354 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4175  ABC transporter related  54.68 
 
 
391 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  47.35 
 
 
402 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  45.13 
 
 
347 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.16 
 
 
343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  45.1 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4507  ABC transporter related protein  43.65 
 
 
367 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462419  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  45.98 
 
 
352 aa  226  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2304  ABC transporter related protein  57.2 
 
 
335 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  43.55 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  44.1 
 
 
349 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1233  ABC transporter related  45.65 
 
 
361 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.642029  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  42.02 
 
 
384 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  43.55 
 
 
350 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  40.5 
 
 
344 aa  193  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1851  ABC transporter related  50.74 
 
 
219 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0521462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  38.72 
 
 
361 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  35.1 
 
 
351 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  30.25 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.32 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.64 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  36.46 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  43.09 
 
 
342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 
369 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.04 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  36.56 
 
 
369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  44.55 
 
 
364 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  36.56 
 
 
369 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0469  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  36.56 
 
 
369 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.66 
 
 
365 aa  173  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  36.56 
 
 
369 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  32.56 
 
 
346 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  45.74 
 
 
354 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.97 
 
 
363 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.28 
 
 
380 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.97 
 
 
374 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.52 
 
 
362 aa  170  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  35.83 
 
 
369 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.7 
 
 
377 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  39.19 
 
 
354 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.69 
 
 
377 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  41.7 
 
 
349 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  42.16 
 
 
351 aa  169  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.57 
 
 
366 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  39.59 
 
 
366 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.08 
 
 
374 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6379  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.93 
 
 
360 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
354 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.97 
 
 
374 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  43.18 
 
 
378 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  43.3 
 
 
349 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.02 
 
 
377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  29.97 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  37.61 
 
 
363 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  37.63 
 
 
374 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  41.77 
 
 
329 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  44.44 
 
 
341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  34.68 
 
 
400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0872  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.61 
 
 
385 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.81 
 
 
387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  43.44 
 
 
328 aa  166  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
349 aa  165  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2913  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.95 
 
 
369 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  41.33 
 
 
368 aa  166  9e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  43.69 
 
 
308 aa  166  9e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.23 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7132  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  42.73 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.91 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.66 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.23 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  42.86 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.74 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.23 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.6 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  42.11 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1055  ABC transporter related  42.42 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3161  ABC transporter related  41.35 
 
 
329 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0305522 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  44.39 
 
 
353 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.05 
 
 
381 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1938  ABC transporter related  50.68 
 
 
325 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2987  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.69 
 
 
366 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238574  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  43.63 
 
 
398 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  42.08 
 
 
349 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 
377 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  32.42 
 
 
366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2123  ABC transporter related  44.75 
 
 
542 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>