More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2797 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  100 
 
 
358 aa  677    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  100 
 
 
358 aa  677    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  100 
 
 
358 aa  677    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  63.91 
 
 
369 aa  424  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  58.36 
 
 
346 aa  319  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3861  ABC transporter related  59.61 
 
 
358 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  52.3 
 
 
367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2536  ABC transporter-related protein  57.66 
 
 
359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  54.39 
 
 
371 aa  292  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  51.08 
 
 
372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  49.31 
 
 
358 aa  276  5e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  48.73 
 
 
347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  47.43 
 
 
361 aa  256  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  45.38 
 
 
384 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  48.29 
 
 
352 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  44.26 
 
 
347 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4175  ABC transporter related  53.22 
 
 
391 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.85 
 
 
343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  45.95 
 
 
402 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  46.2 
 
 
354 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  45.43 
 
 
354 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1233  ABC transporter related  51.15 
 
 
361 aa  226  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.642029  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4507  ABC transporter related protein  43.57 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462419  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  44.8 
 
 
344 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2304  ABC transporter related protein  56.14 
 
 
335 aa  199  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  40.16 
 
 
385 aa  195  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  41.99 
 
 
349 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1851  ABC transporter related  48.29 
 
 
219 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0521462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.07 
 
 
356 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.07 
 
 
356 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  39.85 
 
 
355 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  39.85 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  39.48 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  39.11 
 
 
355 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  39.48 
 
 
355 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  39.48 
 
 
355 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
371 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.3 
 
 
359 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  37.21 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 
353 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  39.11 
 
 
355 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 
353 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.88 
 
 
377 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.99 
 
 
378 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 
353 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  37.71 
 
 
360 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 
355 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  34.53 
 
 
366 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  36.14 
 
 
377 aa  176  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  39.13 
 
 
356 aa  176  6e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  34.44 
 
 
366 aa  176  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 
357 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1601  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  40.77 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  36.06 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  36.06 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  36.06 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37 
 
 
380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.64 
 
 
356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  37.64 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  33.43 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.81 
 
 
349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  41.82 
 
 
378 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.51 
 
 
359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.12 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2939  ABC transporter ATP-binding protein  40.99 
 
 
358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.878604  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.11 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  42.11 
 
 
372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  31.88 
 
 
336 aa  173  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  40.06 
 
 
368 aa  173  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 
355 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 
372 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  40.09 
 
 
337 aa  172  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3216  ABC transporter related  40.54 
 
 
361 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2869  ABC transporter related  40.79 
 
 
361 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0665765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  36.16 
 
 
356 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.23 
 
 
366 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  33.85 
 
 
330 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  31.67 
 
 
336 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 
330 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  49.28 
 
 
247 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  44.16 
 
 
308 aa  171  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  39.47 
 
 
353 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.18 
 
 
375 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.18 
 
 
375 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.43 
 
 
376 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  39.07 
 
 
353 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.69 
 
 
356 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  33.85 
 
 
330 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.43 
 
 
362 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.48 
 
 
384 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.55 
 
 
367 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  33.91 
 
 
357 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  33.85 
 
 
318 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  33.85 
 
 
318 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  33.85 
 
 
330 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  38.26 
 
 
360 aa  169  5e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3459  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.11 
 
 
378 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>