More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1300 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  100 
 
 
356 aa  719    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  79.49 
 
 
356 aa  604  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  77.75 
 
 
360 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  53.44 
 
 
370 aa  365  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  54.74 
 
 
355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  48.55 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  54.04 
 
 
355 aa  306  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  48.18 
 
 
353 aa  301  1e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  57.42 
 
 
363 aa  296  5e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46 
 
 
369 aa  290  3e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0657  ABC transporter related protein  44.13 
 
 
353 aa  290  4e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  46.53 
 
 
367 aa  290  4e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  46.53 
 
 
367 aa  290  4e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  50.75 
 
 
359 aa  287  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  45.61 
 
 
358 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  42.39 
 
 
373 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  40.22 
 
 
369 aa  286  5e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  43.68 
 
 
357 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  41.6 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  39.95 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  45.79 
 
 
374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  46.98 
 
 
353 aa  281  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.05 
 
 
369 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  45.79 
 
 
366 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  43.89 
 
 
358 aa  281  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0650  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
364 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  45.14 
 
 
366 aa  280  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.95 
 
 
351 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.44 
 
 
364 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0408  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47 
 
 
366 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  40.27 
 
 
363 aa  279  5e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  44.63 
 
 
364 aa  278  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0811  ABC transporter related protein  47.13 
 
 
371 aa  278  1e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  47.52 
 
 
375 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.24 
 
 
367 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  46.48 
 
 
367 aa  278  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  50.5 
 
 
365 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.31 
 
 
351 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  43.47 
 
 
384 aa  277  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0114  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.48 
 
 
359 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  42.94 
 
 
368 aa  276  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  44.73 
 
 
367 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  44.72 
 
 
380 aa  275  8e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  50.6 
 
 
365 aa  275  9e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  46.2 
 
 
371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  45.03 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  45.03 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  44.28 
 
 
352 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  42.12 
 
 
370 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.22 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  42.15 
 
 
398 aa  272  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  45.19 
 
 
368 aa  272  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  41.34 
 
 
353 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  42.23 
 
 
370 aa  272  7e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  43.48 
 
 
381 aa  272  8.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 
376 aa  271  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  45.36 
 
 
367 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  42.72 
 
 
378 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  40.49 
 
 
372 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
349 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  44.07 
 
 
392 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2554  ABC transporter related  45.07 
 
 
369 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 
351 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  45.48 
 
 
367 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  46.69 
 
 
358 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  42.62 
 
 
370 aa  270  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  42.37 
 
 
352 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.27 
 
 
365 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  45.07 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  42.98 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  39.9 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  41.05 
 
 
355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  48.16 
 
 
365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.42 
 
 
349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
364 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  46.98 
 
 
375 aa  270  4e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  45.85 
 
 
366 aa  269  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  45.94 
 
 
362 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  43.9 
 
 
370 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
364 aa  269  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  40.7 
 
 
370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  49.08 
 
 
349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.8 
 
 
365 aa  268  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 
365 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  44.1 
 
 
402 aa  268  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
364 aa  268  8e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  38.74 
 
 
366 aa  268  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  43.33 
 
 
353 aa  268  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.86 
 
 
361 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  47.42 
 
 
340 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  41.57 
 
 
349 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  47.23 
 
 
426 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  39.94 
 
 
373 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5468  ABC transporter related  50.2 
 
 
336 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  46.27 
 
 
370 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.71 
 
 
349 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  43.66 
 
 
338 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  43.79 
 
 
385 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  40.73 
 
 
356 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>