More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0782 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  100 
 
 		 356 aa  716    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  82.82 
 
 		 360 aa  612  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  79.49 
 
 		 356 aa  604  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  53.87 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  47.12 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  46.85 
 
 		 355 aa  306  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  49.14 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  48.46 
 
 		 353 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  50.59 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  44.35 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0657  ABC transporter related protein  43.91 
 
 		 353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  44.54 
 
 		 366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  47.15 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  47.15 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 374 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  43.53 
 
 		 357 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  43.29 
 
 		 369 aa  280  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.93 
 
 		 367 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  43.53 
 
 		 353 aa  279  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  45.89 
 
 		 378 aa  279  6e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  43.51 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.22 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  44.98 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  44.81 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0811  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 371 aa  276  3e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  43.7 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  47.89 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 358 aa  275  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.78 
 
 		 351 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  43.43 
 
 		 367 aa  275  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  44.74 
 
 		 355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.22 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  41.64 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  41.76 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  39.07 
 
 		 369 aa  272  6e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  41.48 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  43.03 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  39.95 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  43.69 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  43.7 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  43.26 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.77 
 
 		 365 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  43.48 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  43.59 
 
 		 373 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  43.48 
 
 		 370 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.55 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.53 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  40 
 
 		 385 aa  269  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  51.98 
 
 		 366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  51.98 
 
 		 366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  42.13 
 
 		 353 aa  268  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  41.96 
 
 		 367 aa  268  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  47.19 
 
 		 365 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  40.76 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.53 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4396  ABC transporter related protein  53.17 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.510739  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  41.32 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  43.05 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  42.34 
 
 		 368 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  44.51 
 
 		 358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  44.51 
 
 		 375 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  42.03 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  43.11 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.35 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  43.31 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 366 aa  265  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  44.61 
 
 		 380 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  41.62 
 
 		 368 aa  265  8.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  43.11 
 
 		 402 aa  265  8.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 		 366 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  39.89 
 
 		 370 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  45.64 
 
 		 371 aa  264  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 364 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 370 aa  264  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.6 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  41 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.6 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.23 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5064  ABC transporter related  44.55 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  45 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5796  ABC transporter related  44.55 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.052397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  44.04 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  42.26 
 
 		 373 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  45.35 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3069  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.55 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  41.21 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  50 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4383  ABC transporter related  44.55 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  41.76 
 
 		 372 aa  262  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  48.63 
 
 		 342 aa  262  4.999999999999999e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1655  ABC transporter related  44.75 
 
 		 361 aa  262  6e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>