More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5796 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3069  ABC sugar transporter, ATPase subunit  96.21 
 
 		 397 aa  697    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5064  ABC transporter related  100 
 
 		 397 aa  801    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4383  ABC transporter related  99.75 
 
 		 397 aa  800    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5796  ABC transporter related  100 
 
 		 397 aa  801    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.052397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1743  ABC-type sugar transport systems, ATPase components  77.39 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0993542  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1077  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  76.88 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.678355  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0235  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  77.14 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1654  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  77.14 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1236  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  76.88 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0069  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  76.88 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284527  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0350  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  76.88 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1175  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  77.34 
 
 		 418 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113323  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6661  ABC transporter related  69.07 
 
 		 386 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  50.54 
 
 		 374 aa  363  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.23 
 
 		 363 aa  362  7.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  47.28 
 
 		 364 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  47.28 
 
 		 364 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 369 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  47.97 
 
 		 369 aa  359  5e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 364 aa  359  5e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  47.67 
 
 		 364 aa  359  6e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  49.33 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  46.76 
 
 		 366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  46.76 
 
 		 366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 363 aa  356  5e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  47.76 
 
 		 381 aa  354  1e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  50.27 
 
 		 369 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.45 
 
 		 358 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  49.86 
 
 		 369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.63 
 
 		 366 aa  352  7e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.63 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  50.82 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  46.2 
 
 		 366 aa  349  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 366 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 366 aa  349  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 366 aa  349  6e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 366 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.75 
 
 		 358 aa  349  6e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 366 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  47.25 
 
 		 364 aa  348  9e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.04 
 
 		 369 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  51.37 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  48.49 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.97 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  50 
 
 		 356 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4584  ABC transporter related  51.08 
 
 		 384 aa  345  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  49.86 
 
 		 352 aa  345  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  46.9 
 
 		 374 aa  345  7e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.55 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.7 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.6 
 
 		 357 aa  345  8e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.7 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  47.44 
 
 		 370 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.05 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.72 
 
 		 357 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 356 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 356 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  48.61 
 
 		 356 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  47.71 
 
 		 372 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  49.45 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  50.14 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.72 
 
 		 357 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 370 aa  343  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  47.8 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  48.1 
 
 		 380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.74 
 
 		 369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  47.8 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  46.61 
 
 		 367 aa  343  4e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  46.61 
 
 		 367 aa  343  4e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 356 aa  343  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.46 
 
 		 359 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 356 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  45.11 
 
 		 385 aa  343  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  50.14 
 
 		 352 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.66 
 
 		 369 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.44 
 
 		 357 aa  342  5e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  49.46 
 
 		 359 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.45 
 
 		 361 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.45 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  50.41 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  47.53 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  50.42 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  46.88 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.27 
 
 		 361 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  47.8 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.73 
 
 		 360 aa  339  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  45.84 
 
 		 372 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  47.25 
 
 		 366 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  45.7 
 
 		 366 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.64 
 
 		 365 aa  338  8e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.96 
 
 		 362 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.37 
 
 		 365 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 356 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>