More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1175 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1077  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  88.25 
 
 
397 aa  705    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.678355  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1236  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  88.25 
 
 
397 aa  705    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0235  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  88.49 
 
 
397 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1175  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
418 aa  829    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113323  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0350  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  88.25 
 
 
397 aa  705    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1654  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  88.49 
 
 
397 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217926  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0069  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  88.25 
 
 
397 aa  705    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284527  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1743  ABC-type sugar transport systems, ATPase components  88.73 
 
 
397 aa  705    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0993542  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3069  ABC sugar transporter, ATPase subunit  77.02 
 
 
397 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5064  ABC transporter related  76.92 
 
 
397 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5796  ABC transporter related  76.92 
 
 
397 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.052397  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4383  ABC transporter related  76.67 
 
 
397 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6661  ABC transporter related  70.34 
 
 
386 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956463  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  50.4 
 
 
363 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.19 
 
 
363 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 
363 aa  360  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  49.21 
 
 
366 aa  356  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  46.61 
 
 
374 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  48.68 
 
 
366 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 
369 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  45.91 
 
 
364 aa  352  8.999999999999999e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  45.55 
 
 
369 aa  350  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.45 
 
 
369 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  47.11 
 
 
366 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  45.91 
 
 
364 aa  350  4e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  47.92 
 
 
370 aa  349  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
364 aa  348  7e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  45.91 
 
 
364 aa  348  7e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  44.85 
 
 
367 aa  347  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  44.85 
 
 
367 aa  347  2e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  44.91 
 
 
367 aa  345  6e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  48.94 
 
 
352 aa  346  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  48.81 
 
 
352 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  47.48 
 
 
374 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  48.16 
 
 
354 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  46.95 
 
 
373 aa  343  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 
373 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  47.47 
 
 
381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  44.06 
 
 
369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.81 
 
 
361 aa  343  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  49.07 
 
 
357 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  46.23 
 
 
370 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.26 
 
 
367 aa  342  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.49 
 
 
362 aa  342  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.23 
 
 
362 aa  342  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  44.33 
 
 
369 aa  342  1e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  49.07 
 
 
356 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
370 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  49.34 
 
 
357 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  47.75 
 
 
360 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  50.13 
 
 
357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  47.88 
 
 
402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.21 
 
 
358 aa  339  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.68 
 
 
357 aa  339  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  47.52 
 
 
369 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  48.01 
 
 
364 aa  339  5e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  47.78 
 
 
360 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  44.06 
 
 
370 aa  338  7e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  43.86 
 
 
366 aa  339  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  45.97 
 
 
366 aa  338  9e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  45.97 
 
 
366 aa  338  9e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 
366 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  45.65 
 
 
364 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  47.11 
 
 
368 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  46.56 
 
 
365 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.02 
 
 
361 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  45.93 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.19 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.23 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  47.53 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  48.81 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  47.23 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  48.18 
 
 
369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.23 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  46.61 
 
 
384 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  45.93 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.02 
 
 
361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  47.09 
 
 
353 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  44.3 
 
 
372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.76 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.02 
 
 
361 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  46.84 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.91 
 
 
360 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.44 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  46.34 
 
 
385 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  52.68 
 
 
406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  48.16 
 
 
356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.23 
 
 
356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.49 
 
 
361 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 
356 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.49 
 
 
361 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.49 
 
 
361 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>