More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2939 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2939  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 358 aa  725    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.878604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2869  ABC transporter related  91.69 
 
 		 361 aa  676    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0665765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3216  ABC transporter related  93.07 
 
 		 361 aa  682    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  69.75 
 
 		 356 aa  488  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  68.82 
 
 		 356 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  69.47 
 
 		 356 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  69.47 
 
 		 356 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  64.15 
 
 		 355 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  64.8 
 
 		 355 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  64.71 
 
 		 355 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  64.8 
 
 		 355 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  64.43 
 
 		 355 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  64.8 
 
 		 355 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  64.43 
 
 		 355 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  63.31 
 
 		 355 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  63.31 
 
 		 355 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  63.31 
 
 		 355 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  63.31 
 
 		 355 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  63.03 
 
 		 355 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  63.03 
 
 		 355 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  63.31 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  63.87 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  63.03 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1308  ABC transporter related  58.31 
 
 		 353 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  45.43 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  41.91 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3161  hypothetical protein  44.26 
 
 		 358 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.38 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  46.94 
 
 		 358 aa  258  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  50.18 
 
 		 342 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.05 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.9 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 376 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.41 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  49.06 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.31 
 
 		 363 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  42.78 
 
 		 357 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  43.43 
 
 		 352 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  44.86 
 
 		 362 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  49.21 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  41.37 
 
 		 353 aa  246  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  43.61 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  42.44 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  47.12 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  45.62 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  47.78 
 
 		 364 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  43.5 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  47.33 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  47.69 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  49.59 
 
 		 388 aa  242  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  46.45 
 
 		 355 aa  242  7e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.95 
 
 		 355 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 367 aa  242  9e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4534  ABC transporter related  44.44 
 
 		 365 aa  241  9e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  50 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  50.61 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  39.34 
 
 		 368 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.6 
 
 		 362 aa  240  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  46.09 
 
 		 356 aa  240  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  45.15 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6112  ABC transporter related  43.99 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  47.58 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  43.75 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0542  ABC transporter related  48.55 
 
 		 346 aa  239  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.999499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  47.18 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  42.95 
 
 		 364 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.62 
 
 		 381 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2235  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.63 
 
 		 364 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.48 
 
 		 365 aa  239  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2547  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.5 
 
 		 364 aa  239  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370363  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  47.37 
 
 		 336 aa  238  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.26 
 
 		 366 aa  238  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  43.62 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  39.89 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6322  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.75 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0819115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2208  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103585  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.31 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1841  ABC transporter related  41.94 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2369  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.74 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  47.39 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.88 
 
 		 359 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.32 
 
 		 384 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  46.45 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  48.41 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5428  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.83 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.48813  normal  0.102518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  43.17 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  42.22 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4665  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.61 
 
 		 380 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.879572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.58 
 
 		 364 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.75 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  51.53 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1871  ABC transporter related  48.08 
 
 		 359 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.541718  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.8 
 
 		 346 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.67 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  45.15 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>