More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1727 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  96.34 
 
 
355 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  96.06 
 
 
355 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  96.34 
 
 
355 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  88.45 
 
 
355 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  96.06 
 
 
355 aa  688    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
355 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  88.45 
 
 
355 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  88.7 
 
 
355 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  96.34 
 
 
355 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  89.58 
 
 
355 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  89.3 
 
 
355 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  88.42 
 
 
355 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  88.7 
 
 
355 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  89.01 
 
 
355 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  96.34 
 
 
355 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  87.01 
 
 
355 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  63.2 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3216  ABC transporter related  62.78 
 
 
361 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  61.97 
 
 
356 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  61.97 
 
 
356 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2869  ABC transporter related  62.5 
 
 
361 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0665765 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  61.97 
 
 
356 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2939  ABC transporter ATP-binding protein  63.87 
 
 
358 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.878604  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1308  ABC transporter related  58.74 
 
 
353 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  49.04 
 
 
363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4534  ABC transporter related  41.55 
 
 
365 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251009  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3161  hypothetical protein  45.38 
 
 
358 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260707  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 
355 aa  263  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  43.64 
 
 
372 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  44.79 
 
 
372 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.57 
 
 
355 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  43.24 
 
 
362 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.36 
 
 
355 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.61 
 
 
362 aa  255  6e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  46.01 
 
 
347 aa  255  7e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  42.54 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.9 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  46.42 
 
 
352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  42.9 
 
 
365 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  43.33 
 
 
347 aa  253  5.000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  47.55 
 
 
350 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  43.54 
 
 
342 aa  250  3e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  42.74 
 
 
353 aa  249  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.13 
 
 
357 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  41.52 
 
 
358 aa  250  3e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
350 aa  249  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.24 
 
 
395 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.69 
 
 
393 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
343 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  42.94 
 
 
350 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  39.04 
 
 
353 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  42.78 
 
 
336 aa  245  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  43.49 
 
 
348 aa  245  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  47 
 
 
355 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  39.89 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.52 
 
 
352 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  43.03 
 
 
357 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.17 
 
 
364 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.21 
 
 
363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.17 
 
 
402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  42.33 
 
 
352 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  44.66 
 
 
336 aa  242  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  41.99 
 
 
356 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.76 
 
 
359 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  38.27 
 
 
353 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2369  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.1 
 
 
373 aa  242  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  42.63 
 
 
347 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.12 
 
 
356 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  46.33 
 
 
364 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  42.68 
 
 
364 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  45.1 
 
 
347 aa  241  1e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.8 
 
 
364 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  48.24 
 
 
399 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.95 
 
 
356 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2366  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.32 
 
 
367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  44.81 
 
 
367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.79 
 
 
378 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.79 
 
 
378 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.75 
 
 
371 aa  239  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.79 
 
 
378 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.48 
 
 
364 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.53 
 
 
377 aa  239  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  37.82 
 
 
354 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4874  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.15 
 
 
360 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.368971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.81 
 
 
370 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  47.1 
 
 
356 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.47 
 
 
355 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.81 
 
 
368 aa  239  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  42.42 
 
 
352 aa  239  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 
357 aa  238  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  43.87 
 
 
353 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  43.75 
 
 
356 aa  238  9e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.44 
 
 
378 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.44 
 
 
378 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  44.66 
 
 
353 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  44.44 
 
 
378 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.62 
 
 
384 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.44 
 
 
378 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.44 
 
 
378 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  43.52 
 
 
364 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>