More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1305 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 353 aa  711    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  54.67 
 
 		 353 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  55.24 
 
 		 353 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  54.96 
 
 		 353 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1819  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.73 
 
 		 353 aa  323  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1403  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 351 aa  317  3e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.579406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2784  ABC-type transporter, ATPase component  45.74 
 
 		 383 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  44.6 
 
 		 348 aa  308  8e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  43.14 
 
 		 351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  43.86 
 
 		 349 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  42.57 
 
 		 361 aa  256  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  39.76 
 
 		 347 aa  255  9e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  40.17 
 
 		 355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  36.01 
 
 		 358 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  42.2 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  41.7 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0527  ABC transporter related  37.86 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.16 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  37.5 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.19 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  39.54 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1263  putrescine transport ATP-binding protein PotG  36.48 
 
 		 381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  36.76 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.12 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2632  ABC transporter-related protein  35.31 
 
 		 357 aa  212  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.014615  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  40.53 
 
 		 347 aa  212  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 347 aa  212  1e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  37.23 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  42.44 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0823  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.65 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.24 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  35.33 
 
 		 347 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  39.64 
 
 		 347 aa  209  6e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.32 
 
 		 377 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.87 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  38.68 
 
 		 632 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  37.37 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  39.27 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.02 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.83 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.18 
 
 		 374 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  36.18 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.8 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3636  ABC transporter related  32.49 
 
 		 369 aa  205  8e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.98 
 
 		 377 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.98 
 
 		 377 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.98 
 
 		 377 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.18 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.64 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.86 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.33 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.86 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.68 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.15 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0505  ABC transporter related  40.2 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.940496 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.53 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0642  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.98 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0375  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 358 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.71 
 
 		 371 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.79 
 
 		 359 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2228  ABC transporter related  43.16 
 
 		 241 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0571204  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  37.55 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.93 
 
 		 375 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  37.17 
 
 		 329 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  36.63 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  35.28 
 
 		 356 aa  202  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  33.05 
 
 		 363 aa  202  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.19 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.11 
 
 		 378 aa  203  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  38.97 
 
 		 367 aa  202  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.25 
 
 		 357 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  36.99 
 
 		 359 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.97 
 
 		 382 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  42.4 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.53 
 
 		 377 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.02 
 
 		 373 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.53 
 
 		 377 aa  202  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  35.76 
 
 		 359 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  36.64 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.42 
 
 		 384 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.93 
 
 		 377 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  36.54 
 
 		 369 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.93 
 
 		 377 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.93 
 
 		 377 aa  202  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  38.3 
 
 		 350 aa  202  9e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  32.75 
 
 		 381 aa  202  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  36.43 
 
 		 373 aa  202  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.6 
 
 		 370 aa  202  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.58 
 
 		 377 aa  202  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  33.75 
 
 		 386 aa  202  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.58 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.58 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.39 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.58 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>