More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0505 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0505  ABC transporter related  100 
 
 		 345 aa  694    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.940496 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  41.58 
 
 		 353 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  40.07 
 
 		 353 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  40.59 
 
 		 353 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  39.71 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  35.61 
 
 		 355 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2784  ABC-type transporter, ATPase component  40.21 
 
 		 383 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  37.43 
 
 		 351 aa  208  9e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  36.98 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  39.56 
 
 		 348 aa  205  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  33.33 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  39.39 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  36.39 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  36.09 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  36.76 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  36.76 
 
 		 346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  38.39 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5458  ABC transporter related  39.69 
 
 		 416 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  37.69 
 
 		 356 aa  198  9e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1829  ABC transporter related  38.19 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.853496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  37.09 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0974  ABC transporter related  36.09 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0227339  unclonable  0.000000000000144331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  35.58 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3264  Sigma 54 interacting domain protein  47.62 
 
 		 231 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  40.74 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  35.49 
 
 		 348 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0210  ABC transporter-related protein  35.24 
 
 		 363 aa  196  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  43.86 
 
 		 319 aa  195  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.91 
 
 		 349 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  35.6 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0375  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 316 aa  195  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0831  ABC transporter related  41.13 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.33 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  39.08 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0214  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  34.94 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  35.52 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  35.21 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  41.89 
 
 		 357 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 		 349 aa  192  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  36.34 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  32.04 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  37.93 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  35.49 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0285  ABC transporter related  33.99 
 
 		 334 aa  192  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0897858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.51 
 
 		 354 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  37.64 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4355  ABC transporter related  38.64 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  37.87 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  37.87 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.01 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  35.2 
 
 		 334 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.49 
 
 		 379 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  37.71 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  37.63 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1299  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 394 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0956135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  37.63 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0053  ABC transporter related  36.64 
 
 		 309 aa  190  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.916211  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2551  ABC transporter related  36.73 
 
 		 347 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 		 368 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2348  ABC transporter related  33.23 
 
 		 368 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.917479  normal  0.103865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  37.11 
 
 		 364 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0057  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  38.35 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.72588  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  33.63 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  36.12 
 
 		 352 aa  189  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3201  ABC transporter component  34.46 
 
 		 359 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1841  ABC transporter related  35.21 
 
 		 361 aa  189  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  40.91 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  32.12 
 
 		 352 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.56 
 
 		 363 aa  189  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  35.91 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  39.03 
 
 		 358 aa  188  9e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.44 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  37.87 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2056  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.938805  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.5 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4466  ABC transporter-like  35.99 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  35.77 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2267  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  34.23 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  35.41 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  36.36 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  39.82 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  36.55 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.91 
 
 		 352 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  34.19 
 
 		 351 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1735  ATP-binding component of transport system for maltose  34.05 
 
 		 376 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  39.62 
 
 		 632 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  35.08 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0320  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  38.08 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  38.64 
 
 		 365 aa  186  5e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2630  ABC transporter related  41.86 
 
 		 378 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0792503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1719  ABC transporter related  33.73 
 
 		 364 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  38.28 
 
 		 347 aa  186  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  35.41 
 
 		 352 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.96 
 
 		 337 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  36.05 
 
 		 376 aa  186  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>