More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1105 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  100 
 
 		 319 aa  636    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  44.97 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  47.9 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  44.97 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  44.57 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  42.9 
 
 		 363 aa  269  4e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  44.13 
 
 		 356 aa  269  4e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  49.16 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  49.16 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  46.28 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  45.88 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  48.82 
 
 		 348 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.74 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  45.26 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  42.34 
 
 		 370 aa  259  4e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  45.23 
 
 		 346 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  43.9 
 
 		 386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1207  ABC transporter related  50.38 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  46.45 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  47.57 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  44.92 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  44.91 
 
 		 323 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  41.13 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  44.59 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  43.77 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  42.94 
 
 		 377 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  45.22 
 
 		 356 aa  255  7e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  56.67 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  44.07 
 
 		 350 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1286  ABC transporter related  47.18 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  43.22 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  41.13 
 
 		 370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  44.14 
 
 		 347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  42.9 
 
 		 357 aa  252  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  43.21 
 
 		 332 aa  252  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  45.7 
 
 		 329 aa  252  7e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  44.26 
 
 		 332 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  44.04 
 
 		 350 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  44.04 
 
 		 350 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  44.04 
 
 		 350 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  42.9 
 
 		 370 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  43.75 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  43.79 
 
 		 342 aa  250  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  38.94 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  48.33 
 
 		 356 aa  249  3e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  40 
 
 		 366 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 		 368 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  46.44 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  39.09 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  48.2 
 
 		 370 aa  248  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0913  ABC transporter related  44.38 
 
 		 361 aa  248  9e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.3 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  39.39 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  48 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.29 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  43.93 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.24 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  43.53 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  43.51 
 
 		 353 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 386 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  51.07 
 
 		 369 aa  246  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  43.95 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3120  ABC transporter, ATPase subunit  47.08 
 
 		 348 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  46.44 
 
 		 363 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  44.91 
 
 		 350 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  44.34 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  41.29 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  49.28 
 
 		 362 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  46.24 
 
 		 332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  45.37 
 
 		 379 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.65 
 
 		 345 aa  245  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.44 
 
 		 378 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 		 353 aa  245  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.44 
 
 		 378 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.44 
 
 		 378 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  41.46 
 
 		 356 aa  245  6.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  43.61 
 
 		 349 aa  245  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.44 
 
 		 378 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  50 
 
 		 344 aa  245  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.44 
 
 		 378 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  38.55 
 
 		 370 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  50.4 
 
 		 391 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  40.52 
 
 		 368 aa  245  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 		 364 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.02 
 
 		 373 aa  245  8e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  54.63 
 
 		 359 aa  244  9e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  52.46 
 
 		 376 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  47.56 
 
 		 367 aa  245  9e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0650  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.04 
 
 		 364 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  38.89 
 
 		 372 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50 
 
 		 372 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  46.67 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  41.14 
 
 		 377 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.62 
 
 		 372 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.83 
 
 		 377 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.28 
 
 		 380 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  42.3 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1416  ABC transporter related  44.82 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>