More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0913 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0913  ABC transporter related  100 
 
 
361 aa  717    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.76 
 
 
355 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.24 
 
 
382 aa  275  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.41 
 
 
354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  47.84 
 
 
358 aa  272  6e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.31 
 
 
382 aa  271  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  54.4 
 
 
402 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.16 
 
 
362 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  48.85 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  53.68 
 
 
334 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  47.95 
 
 
386 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.34 
 
 
352 aa  263  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.52 
 
 
370 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  44.02 
 
 
353 aa  262  8e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.84 
 
 
383 aa  262  8e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5898  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.68 
 
 
371 aa  261  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.75 
 
 
354 aa  261  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  43.93 
 
 
381 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 
347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.06 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.36 
 
 
356 aa  259  7e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  42.46 
 
 
357 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.01 
 
 
382 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.32 
 
 
447 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  45.72 
 
 
348 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0974  ABC transporter related  53.78 
 
 
328 aa  258  1e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0227339  unclonable  0.000000000000144331 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.12 
 
 
341 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  47.52 
 
 
366 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  47.68 
 
 
356 aa  257  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.07 
 
 
352 aa  256  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.91 
 
 
357 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.89 
 
 
349 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.77 
 
 
348 aa  255  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04250  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.57 
 
 
349 aa  255  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2398  ABC transporter  40.56 
 
 
384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0142955  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.4 
 
 
372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  48.06 
 
 
365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2664  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.33 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.16 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  44.97 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0754  ABC transporter related  43.75 
 
 
363 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.64 
 
 
378 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  46.47 
 
 
352 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.9 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  48.18 
 
 
357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  46.33 
 
 
388 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0366  ABC transporter related  50.85 
 
 
327 aa  253  5.000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1829  ABC transporter related  52.59 
 
 
328 aa  252  6e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.853496 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  47.22 
 
 
356 aa  252  6e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  50.34 
 
 
527 aa  252  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0285  ABC transporter related  52.59 
 
 
334 aa  252  7e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0897858  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  43.61 
 
 
353 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.38 
 
 
363 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4476  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  48.5 
 
 
380 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.041416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.58 
 
 
372 aa  250  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4610  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  48.5 
 
 
380 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.51549  normal  0.957495 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  46.3 
 
 
347 aa  250  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 
349 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.83 
 
 
357 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  44.03 
 
 
348 aa  250  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  41.53 
 
 
343 aa  250  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  49.26 
 
 
356 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 
370 aa  250  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  45.34 
 
 
353 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  48.9 
 
 
356 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  41.83 
 
 
346 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.82 
 
 
387 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  41.83 
 
 
346 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  41.83 
 
 
346 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  44.24 
 
 
353 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.03 
 
 
370 aa  249  5e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.44 
 
 
330 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  45.73 
 
 
342 aa  249  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  48.96 
 
 
360 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  41.51 
 
 
363 aa  249  6e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.16 
 
 
388 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.84 
 
 
370 aa  249  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.16 
 
 
388 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.22 
 
 
423 aa  249  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.46 
 
 
345 aa  248  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.16 
 
 
388 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  50.39 
 
 
350 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  43.15 
 
 
364 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.31 
 
 
374 aa  248  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  44.37 
 
 
329 aa  248  1e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.54 
 
 
359 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.14 
 
 
386 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.38 
 
 
384 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.93 
 
 
384 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  44.09 
 
 
386 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2267  ABC transporter related protein  43.39 
 
 
351 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  46.25 
 
 
347 aa  248  1e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.14 
 
 
386 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.79 
 
 
380 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.14 
 
 
386 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  53.78 
 
 
371 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.69 
 
 
390 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  52.89 
 
 
372 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.63 
 
 
363 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>