More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1024 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  100 
 
 
335 aa  680    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  46.98 
 
 
355 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  39.13 
 
 
347 aa  237  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  46.67 
 
 
348 aa  233  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  46.86 
 
 
351 aa  232  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  46.25 
 
 
345 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.85 
 
 
376 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  44.4 
 
 
355 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 
353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2632  ABC transporter-related protein  40.26 
 
 
357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.014615  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  44.81 
 
 
361 aa  215  9e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  41.67 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  42.08 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  48.05 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1403  ABC transporter related protein  43.6 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.579406  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.1 
 
 
366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0831  ABC transporter related  44.4 
 
 
314 aa  211  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  41.25 
 
 
353 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.21 
 
 
382 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0057  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  44.35 
 
 
312 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.72588  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.1 
 
 
402 aa  210  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0642  ABC transporter related protein  48.73 
 
 
342 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0527  ABC transporter related  38.34 
 
 
348 aa  209  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  42.86 
 
 
364 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  43.51 
 
 
312 aa  209  7e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1819  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 
353 aa  208  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147813  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1829  ABC transporter related  41 
 
 
328 aa  207  2e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.853496 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  43.27 
 
 
388 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  40.99 
 
 
352 aa  207  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.32 
 
 
357 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.28 
 
 
370 aa  206  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  43.1 
 
 
352 aa  206  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3522  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.7 
 
 
384 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.185536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.32 
 
 
380 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.28 
 
 
368 aa  205  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.32 
 
 
380 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661243  hitchhiker  0.000000930284 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.85 
 
 
362 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 
373 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0766  ABC transporter related  42.19 
 
 
312 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.812823  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.78 
 
 
370 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  43.5 
 
 
357 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3645  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.95 
 
 
342 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  36.91 
 
 
347 aa  202  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  36.31 
 
 
346 aa  202  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.87 
 
 
360 aa  202  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.42 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.22 
 
 
373 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  34.21 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  35.24 
 
 
341 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.43 
 
 
355 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  34.22 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  37.37 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1694  ABC transporter related  40.64 
 
 
341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.39 
 
 
368 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.97 
 
 
384 aa  200  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
386 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 
388 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.25 
 
 
355 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  36.31 
 
 
346 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2309  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
386 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.04 
 
 
423 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2178  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
386 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1300  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
378 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2784  ABC-type transporter, ATPase component  41.53 
 
 
383 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1057  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
386 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1787  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
386 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0108  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
386 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432666  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41 
 
 
355 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  40.98 
 
 
372 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.04 
 
 
359 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.92 
 
 
377 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.92 
 
 
377 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.92 
 
 
377 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.92 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4672  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 
376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.22 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.38 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.09 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  35.78 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  40.5 
 
 
527 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.38 
 
 
359 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.84 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.45 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2122  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  34.83 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  39.13 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2057  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0901178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.66 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  41.42 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.42 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04080  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  42.68 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.74 
 
 
381 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  35.42 
 
 
356 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.75 
 
 
372 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0974  ABC transporter related  39.08 
 
 
328 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0227339  unclonable  0.000000000000144331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.53 
 
 
386 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1299  ABC transporter related protein  39.67 
 
 
394 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0956135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>